RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519081.1

RNU6-988P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 988, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-988P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-988P-201ENST00000519081 SLC10A7Q0GE19 358 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 TMEM183BQ1AE95 376 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 TYSND1Q2T9J0 566 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 HECTD3Q5T447 861 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 OR8G2PQ6IF36 304 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 FRMPD2BQ6IN97 320 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 LINC00696Q6ZRV3 163 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 TMEM183AQ8IXX5 376 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 ACER1Q8TDN7 264 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 PGLYRP4Q96LB8 373 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 TSG101Q99816 390 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZNF416Q9BWM5 594 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 ERVK-6Q9BXR3 956 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 AP1M1Q9BXS5 423 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 NGBQ9NPG2 151 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 APPL1Q9UKG1 709 aa0.56□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP0.56□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 A0A1B0GW55 424 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 E9PBE3 544 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 HSPA4LO95757 839 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 DUX4L2P0CJ85 424 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 DUX4L3P0CJ86 424 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 DUX4L5P0CJ88 424 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 DUX4L6P0CJ89 424 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 DUX4L7P0CJ90 424 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 MAGEA4P43358 317 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 CRISP1P54107 249 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 CASP9P55211 416 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 C17orf67Q0P5P2 114 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 CCDC173Q0VFZ6 552 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 AARDQ4LEZ3 155 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 C1orf100Q5SVJ3 147 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 KCTD9Q7L273 389 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 PRSS41Q7RTY9 318 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 CERS3Q8IU89 383 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 OR51S1Q8NGJ8 323 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 PAQR8Q8TEZ7 354 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 SLC25A36Q96CQ1 311 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 COMMD4Q9H0A8 199 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 TMEM245Q9H330 911 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 CCL28Q9NRJ3 127 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 DUX4Q9UBX2 424 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 LIPT1Q9Y234 373 aa0.55□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 PP2D1A8MPX8 630 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 SUPT3HO75486 399 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 LALBAP00709 142 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 LINC00869P0C866 280 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 PSMC3P17980 439 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 SERPINA2P20848 420 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 SLC6A8P48029 635 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 RBP5P82980 135 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 SPIBQ01892 262 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 TGFBR3Q03167 851 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 TFDP1Q14186 410 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 TIGITQ495A1 244 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 FUT11Q495W5 492 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 LIPNQ5VXI9 398 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 FBXW9Q5XUX1 488 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 C1orf94Q6P1W5 598 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 NEK5Q6P3R8 708 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 P4HA3Q7Z4N8 544 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 NRMQ8IXM6 262 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 SYNPRQ8TBG9 265 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 PHYHIPQ92561 330 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 LZTS2Q9BRK4 669 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZNF226Q9NYT6 803 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 TREM2Q9NZC2 230 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 COPS7AQ9UBW8 275 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZNF222Q9UK12 451 aa0.54□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 ZNF407Q9C0G0 2248 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 TMEM89A2RUT3 159 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 CASKO14936 926 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 TPST2O60704 377 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 SRP72O76094 671 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 ADRA2AP08913 450 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 UROSP10746 265 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 PLK1P53350 603 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 NUCB1Q02818 461 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 CHRNB3Q05901 458 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 NME3Q13232 169 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 PPP2R5CQ13362 524 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP0.53□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 GRB7Q14451 532 aa0.53□□□□□ -2.32
RNU6-988P-201ENST00000519081 IFI44LQ53G44 452 aa0.53□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms