RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 XKR4Q5GH76 650 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-221ENST00000514231 C15orf54Q8N8G6 183 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-221ENST00000514231 PAQR8Q8TEZ7 354 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-221ENST00000514231 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-221ENST00000514231 TPK1Q9H3S4 243 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-221ENST00000514231 PLGRKTQ9HBL7 147 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-221ENST00000514231 NUDCQ9Y266 331 aa2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-221ENST00000514231 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
PDE4D-221ENST00000514231 SSX5O60225 188 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-221ENST00000514231 OR10H3O60404 316 aa2.74□□□□□ -1.97
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PDE4D-221ENST00000514231 SFNP31947 248 aa2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-221ENST00000514231 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-221ENST00000514231 BDKRB1P46663 353 aa2.74□□□□□ -1.97
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PDE4D-221ENST00000514231 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
PDE4D-221ENST00000514231 C6orf120Q7Z4R8 191 aa2.74□□□□□ -1.97
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PDE4D-221ENST00000514231 SVOPLQ8N434 492 aa2.74□□□□□ -1.97
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PDE4D-221ENST00000514231 SPACA6W5XKT8 324 aa2.74□□□□□ -1.97
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PDE4D-221ENST00000514231 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa2.73□□□□□ -1.97
PDE4D-221ENST00000514231 PPIAL4DF5H284 164 aa2.73□□□□□ -1.97
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PDE4D-221ENST00000514231 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
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PDE4D-221ENST00000514231 KCNA7Q96RP8 456 aa2.73□□□□□ -1.97
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PDE4D-221ENST00000514231 LINC00483Q53H64 154 aa2.72□□□□□ -1.97
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PDE4D-221ENST00000514231 OR5AU1Q8NGC0 362 aa2.72□□□□□ -1.97
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PDE4D-221ENST00000514231 ARL6IP1Q15041 203 aa2.71□□□□□ -1.98
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PDE4D-221ENST00000514231 ACAT2Q9BWD1 397 aa2.71□□□□□ -1.98
PDE4D-221ENST00000514231 LHX9Q9NQ69 397 aa2.71□□□□□ -1.98
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PDE4D-221ENST00000514231 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa2.71□□□□□ -1.98
PDE4D-221ENST00000514231 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa2.71□□□□□ -1.98
PDE4D-221ENST00000514231 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.71□□□□□ -1.98
PDE4D-221ENST00000514231 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
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