RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493536.5

SNHG16-202, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG16, Length 2,424 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG16-202ENST00000493536 PCOLCEQ15113 449 aa8.06□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 C12orf73Q69YU5 71 aa8.06□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF620Q6ZNG0 422 aa8.06□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 SPARTQ8N0X7 666 aa8.06□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 OR52L1Q8NGH7 329 aa8.06□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 PLEKHA8Q96JA3 519 aa8.06□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 LRFN3Q9BTN0 628 aa8.06□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 IL20Q9NYY1 176 aa8.06□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 IL20RAQ9UHF4 553 aa8.06□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 TCFL5Q9UL49 500 aa8.06□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 A0A087WUJ7 227 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 TRIM64CA6NLI5 447 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 EFCAB9A8MZ26 197 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 OIP5O43482 229 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 RCBTB2O95199 551 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 PNMTP11086 282 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 COX6A1P12074 109 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 GABRB1P18505 474 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 MAKP20794 623 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 PCYT1AP49585 367 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 RPS18P62269 152 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 SLC35A2P78381 396 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 TEKQ02763 1124 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 CBFBQ13951 182 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 FOXB2Q5VYV0 432 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 ACSM5Q6NUN0 579 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 SLC30A6Q6NXT4 461 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 CCDC81Q6ZN84 652 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 PIP4P1Q86T03 277 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 OAFQ86UD1 273 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 STX19Q8N4C7 294 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 OR2T33Q8NG76 320 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 FANK1Q8TC84 345 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 CT55Q8WUE5 264 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 MYDGFQ969H8 173 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 TMIGD2Q96BF3 282 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 RHNO1Q9BSD3 238 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 COPS4Q9BT78 406 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 RTN4RQ9BZR6 473 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF700Q9H0M5 742 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 DUSP21Q9H596 190 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 ERVK-18Q9QC07 812 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 CDH10Q9Y6N8 788 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 MPDZO75970 2070 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 SDK2Q58EX2 2172 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 SH3D21A4FU49 640 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 TMEM200CA6NKL6 621 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 ENO4A6NNW6 628 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 CLCA1A8K7I4 914 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 KLF4O43474 513 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 FADS1O60427 444 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 DLGAP3O95886 979 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 CH25HO95992 272 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 NAGAP17050 411 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 FUT1P19526 365 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 PGCP20142 388 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 SLC1A3P43003 542 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 ALDH3B2P48448 385 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 CTBP2P56545 445 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 PMS2P3Q13401 168 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 NDUFAF7Q7L592 441 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 GLRX5Q86SX6 157 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 ESX1Q8N693 406 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 OR11G2Q8NGC1 345 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 OR8D4Q8NGM9 314 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 OR51A7Q8NH64 312 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 ELP5Q8TE02 316 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 DUSP19Q8WTR2 217 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 C3orf49Q96BT1 292 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 SAMD8Q96LT4 415 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF426Q9BUY5 554 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 OR52D1Q9H346 318 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 SLC25A19Q9HC21 320 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF160Q9HCG1 818 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 KLRF1Q9NZS2 232 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 FOXJ2Q9P0K8 574 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 EXPH5Q8NEV8 1989 aa8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 TRAV27A0A087WT01 109 aa8.04□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 HCN1O60741 890 aa8.04□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 ITGA10O75578 1167 aa8.04□□□□□ -1.12
SNHG16-202ENST00000493536 TNFSF15O95150 251 aa8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms