RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	BTG2	P78543	158 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	HSPB3	Q12988	150 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	MTX3	Q5HYI7	312 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	MFSD12	Q6NUT3	480 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	AAGAB	Q6PD74	315 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM205	Q6UW68	189 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	OR2T12	Q8NG77	320 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM110B	Q8TC76	370 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	RNF138	Q8WVD3	245 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	VSTM2L	Q96N03	204 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	CENPO	Q9BU64	300 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	CTSF	Q9UBX1	484 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	RARRES3	Q9UL19	164 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	NCKAP5	O14513	1909 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	ATM	Q13315	3056 aa		5.24	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	FREM3	P0C091	2139 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	CXCR6	O00574	342 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	AHCYL1	O43865	530 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	FKBP6	O75344	327 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	PTP4A3	O75365	173 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	CREG1	O75629	220 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	KRT36	O76013	467 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	NKX2-2	O95096	273 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	ATP6V1G2	O95670	118 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	KRT75	O95678	551 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	EPPIN	O95925	133 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	HMGN2	P05204	90 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	CLEC3B	P05452	202 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	UMOD	P07911	640 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	ELANE	P08246	267 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	ACP2	P11117	423 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	UBL4A	P11441	157 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	SFTPC	P11686	197 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	MAOA	P21397	527 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	GATA3	P23771	443 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	PTGER1	P34995	402 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	EMD	P50402	254 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	CDH15	P55291	814 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	SLC37A1	P57057	533 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	PSG6	Q00889	435 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	PLIN5	Q00G26	463 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	SERTAD2	Q14140	314 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	FLOT2	Q14254	428 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	TBCE	Q15813	527 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
DCTN1-222	ENST00000492717	CDC73	Q6P1J9	531 aa		5.23	□□□□□ -1.57

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