RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 TRPC4Q9UBN4 977 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 SPACA6W5XKT8 324 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 CHD8Q9HCK8 2581 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM150CB9EJG8 249 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 OR2B3O76000 313 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 TP53P04637 393 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 HMGN1P05114 100 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 OR12D1P0DN82 309 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 MMP11P24347 488 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 FPR3P25089 353 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 GALNSP34059 522 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 NBL1P41271 181 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 AVPR1BP47901 424 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 INPP1P49441 399 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 TAS2R41P59536 307 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 EFNB1P98172 346 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ST3GAL3Q11203 375 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 BIKQ13323 160 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 LTB4RQ15722 352 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 LPAL2Q16609 132 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 BAK1Q16611 211 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 C22orf42Q6IC83 251 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 PLET1Q6UQ28 207 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM107Q6UX40 140 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 SPATC1Q76KD6 591 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 RRM2BQ7LG56 351 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ASCL5Q7RTU5 278 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 SZRD1Q7Z422 152 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 NOXA1Q86UR1 476 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 GID4Q8IVV7 300 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 KLHL36Q8N4N3 616 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 POGLUT1Q8NBL1 392 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 MORN4Q8NDC4 146 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 NUP43Q8NFH3 380 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 IFI44Q8TCB0 444 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 RAB8BQ92930 207 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 C16orf58Q96GQ5 468 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 SLX1AQ9BQ83 275 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 KCNN2Q9H2S1 579 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 SMOC1Q9H4F8 434 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 LANCL2Q9NS86 450 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 FGF21Q9NSA1 209 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 MAT2BQ9NZL9 334 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 SERTAD3Q9UJW9 196 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 GMEB2Q9UKD1 530 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 A8MU76 341 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 M0R3H8 397 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 CASKO14936 926 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ORC5O43913 435 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 LDB3O75112 727 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 CYP7B1O75881 506 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 GP1BAP07359 652 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 CSF3P09919 207 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 CD53P19397 219 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ACP1P24666 158 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 PRKAR1BP31321 381 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 PTGER1P34995 402 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ETV5P41161 510 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 MC3RP41968 323 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ETV1P50549 477 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 HSD17B7P56937 341 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 DAB2P98082 770 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 FUT5Q11128 374 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 TRAM1Q15629 374 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 HACD4Q5VWC8 232 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 NXNL2Q5VZ03 156 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 BICRALQ6AI39 1079 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 TCEAL6Q6IPX3 200 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 MFSD12Q6NUT3 480 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ZER1Q7Z7L7 766 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 PLCZ1Q86YW0 608 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 IQCF1Q8N6M8 205 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 SUMF1Q8NBK3 374 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 OR51Q1Q8NH59 317 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 C17orf50Q8WW18 174 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 XAGE5Q8WWM1 108 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 KAT2AQ92830 837 aa8.87□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 FGF11Q92914 225 aa8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms