RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480171.7

PKP4-210, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 2,772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-210ENST00000480171 FOXK2Q01167 660 aa8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 TNFRSF17Q02223 184 aa8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 RELQ04864 619 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 PDGFRLQ15198 375 aa8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 OR1Q1Q15612 314 aa8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 RPE65Q16518 533 aa8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 ACSM3Q53FZ2 586 aa8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 IGSF11Q5DX21 431 aa8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 CEP78Q5JTW2 689 aa8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 ASPGQ86U10 573 aa8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 CACUL1Q86Y37 369 aa8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 DTX3Q8N9I9 347 aa8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 SLC2A12Q8TD20 617 aa8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 GPR137Q96N19 417 aa8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 SDF2Q99470 211 aa8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 GHITMQ9H3K2 345 aa8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 ABRACLQ9P1F3 81 aa8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 SLC23A1Q9UHI7 598 aa8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 MGAT4AQ9UM21 535 aa8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 SATB2Q9UPW6 733 aa8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 BAIAP2Q9UQB8 552 aa8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 MED31Q9Y3C7 131 aa8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 TRPM6Q9BX84 2022 aa8.06□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 TBC1D3EA0A087X179 549 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 FMO6PO60774 539 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 UBL3O95164 117 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 TCRBP04435 133 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 SBK2P0C263 348 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 SAGP10523 405 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 ZNF3P17036 446 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 MAKP20794 623 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 OR10A3P58181 314 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 POU4F2Q12837 409 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 DUSP5Q16690 384 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 GAB4Q2WGN9 574 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 FAM209AQ5JX71 171 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 GARNL3Q5VVW2 1013 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 SIGIRRQ6IA17 410 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 ZNF425Q6IV72 752 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 OR2L13Q8N349 312 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 PFN4Q8NHR9 129 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 BPIFA2Q96DR5 249 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 C4orf36Q96KX1 117 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 ABHD1Q96SE0 405 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 C14orf105Q9NVL8 296 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 SPHK1Q9NYA1 384 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 FBXL21Q9UKT6 434 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 URADA6NGE7 173 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 LRRN3E7EW58 273 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 E9PI62 339 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 ARL6IP5O75915 188 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 IFNGP01579 166 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 SLC35G6P0C7Q6 338 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 UQCRC1P31930 480 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 RAG2P55895 527 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 CLDN2P57739 230 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 CST6Q15828 149 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 AMZ1Q400G9 498 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 FAM27D1Q5T7N8 215 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 AGBL4Q5VU57 503 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 PXKQ7Z7A4 578 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 PAQR7Q86WK9 346 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 SFTPA1Q8IWL2 248 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 SPPL3Q8TCT6 385 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 SMPDL3BQ92485 455 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 PTP4A1Q93096 173 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 C10orf90Q96M02 699 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 TIMP4Q99727 224 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 CACNG6Q9BXT2 260 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 ACTR6Q9GZN1 396 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 WNT5BQ9H1J7 359 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 LRRN3Q9H3W5 708 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 EVA1AQ9H8M9 152 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 TMEM27Q9HBJ8 222 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 CLDND1Q9NY35 253 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 A0A1B0GVC2 190 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 A0A1B0GVI7 797 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 A6NIN4 97 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 RFXAPO00287 272 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 BTN3A3O00478 584 aa8.05□□□□□ -1.12
PKP4-210ENST00000480171 ADH1BP00325 375 aa8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms