RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 NINQ8N4C6 2090 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A1B0GWA3 101 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 A0A1W2PRQ8 180 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 C2orf72A6NCS6 295 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 G3V3Y1 287 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 MGRN1O60291 552 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 ZIC3O60481 467 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 CBR3O75828 277 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 KRT36O76013 467 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF17P17021 662 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 ITGA2P17301 1181 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 ADH6P28332 368 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 SRD5A2P31213 254 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 GCKP35557 465 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC1A3P43003 542 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 ERFP50548 548 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 HMGA2P52926 109 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 HOXC5Q00444 222 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 RBPJQ06330 500 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 DGCR6Q14129 220 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 QPRTQ15274 297 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 ATP6AP1Q15904 470 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 WBP2NLQ6ICG8 309 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 OR5M10Q6IEU7 315 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 ARSKQ6UWY0 536 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 FKBP9P1Q75LS8 142 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 GRINAQ7Z429 371 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 ATCAYQ86WG3 371 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 C10orf67Q8IYJ2 551 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 OR1J4Q8NGS1 313 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 POC1BQ8TC44 478 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 PYDC1Q8WXC3 89 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 ZBTB8AQ96BR9 441 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 MRGPRX4Q96LA9 322 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 TAAR6Q96RI8 345 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF347Q96SE7 839 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 SEPHS2Q99611 448 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 MCHR1Q99705 422 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 PIP5K1AQ99755 562 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 PRSS27Q9BQR3 290 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 DSN1Q9H410 356 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 NTN4Q9HB63 628 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 VNN3Q9NY84 501 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 MED11Q9P086 117 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 RIMS3Q9UJD0 308 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC13A4Q9UKG4 626 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 NTNG1Q9Y2I2 539 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 AP4S1Q9Y587 144 aa8.5□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 PCNX3Q9H6A9 2034 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 COL6A6A6NMZ7 2263 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 TRAPPC13A5PLN9 417 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 J3KTA2 159 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 hCG_2039718K7EN88 272 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 CHP2O43745 196 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 NPIPB7O75200 414 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 IGF2P01344 180 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 IGHG3P01860 377 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 MT-ND1P03886 318 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 PRB1P04280 392 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 FCGR1AP12314 374 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 UQCRBP14927 111 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 PGCP20142 388 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 ELK4P28324 431 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 SESN3P58005 492 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 PMP22Q01453 160 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 FOXF1Q12946 379 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 TOMM20Q15388 145 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 OR1Q1Q15612 314 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 COLEC12Q5KU26 742 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 ENTPD8Q5MY95 495 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 HMBOX1Q6NT76 420 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 WDR88Q6ZMY6 472 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 GDF7Q7Z4P5 450 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF843Q8N446 348 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM109AQ8N4B1 249 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM251Q8N6I4 163 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 OR4K17Q8NGC6 315 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 FAR1Q8WVX9 515 aa8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
SH3BP4-207ENST00000454947 MPP4Q96JB8 637 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.6 ms