RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449189.1

PKN2-205, Transcript of protein kinase N2, human

TSL 3

Gene PKN2, Length 342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN2-205	ENST00000449189	PLIN5	Q00G26	463 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	STX5	Q13190	355 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	NAE1	Q13564	534 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	HERPUD1	Q15011	391 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	EFNB3	Q15768	340 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	LGSN	Q5TDP6	509 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	PARP8	Q8N3A8	854 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	HAUS1	Q96CS2	278 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	OMA1	Q96E52	524 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	RAX2	Q96IS3	184 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	P2RY12	Q9H244	342 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	GLRX2	Q9NS18	164 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	MED11	Q9P086	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	AUP1	Q9Y679	476 aa		4.36	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	OR6C76	A6NM76	312 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	SCO2	O43819	266 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	PLOD3	O60568	738 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	ANXA9	O76027	345 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	SERPINA6	P08185	405 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	TNNT1	P13805	278 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	PSMA3	P25788	255 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	AHR	P35869	848 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	NPY2R	P49146	381 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	LGALS4	P56470	323 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	SESN3	P58005	492 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	NHLH2	Q02577	135 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	SNTA1	Q13424	505 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	ODF1	Q14990	250 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	SPATA21	Q7Z572	469 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	TRIM58	Q8NG06	486 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	OR4L1	Q8NH43	312 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	RNF128	Q8TEB7	428 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	RIT1	Q92963	219 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	OR4K3	Q96R72	315 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	DOK1	Q99704	481 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	NPAS1	Q99742	590 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	SYT11	Q9BT88	431 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	CENPH	Q9H3R5	247 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189		A0A0J9YW62	118 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PKN2-205	ENST00000449189		A0A1W2PS29	197 aa		4.34	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms