RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFAB1	O14561	156 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CYP7B1	O75881	506 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	FAM107A	O95990	144 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	IL18BP	O95998	194 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CRH	P06850	196 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	PCGF2	P35227	344 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	SESN3	P58005	492 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	PLAUR	Q03405	335 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	SRY	Q05066	204 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	EPS8	Q12929	822 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	OR2A2	Q6IF42	318 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	GRINA	Q7Z429	371 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	GGN	Q86UU5	652 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	PTOV1	Q86YD1	416 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	C10orf111	Q8N326	155 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	RPRML	Q8N4K4	120 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	TRIB1	Q96RU8	372 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0G2JNJ9	132 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	RCBTB2	O95199	551 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	GP1BB	P13224	206 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	SLC1A3	P43003	542 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	GZMM	P51124	257 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CLDN15	P56746	228 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CLDN20	P56880	219 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	VEZF1	Q14119	521 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	VRK2	Q86Y07	508 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	LILRA2	Q8N149	483 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	OR10A6	Q8NH74	314 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF563	Q8TA94	476 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	RCN3	Q96D15	328 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	ADGRG7	Q96K78	797 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	KLHL15	Q96M94	604 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CHST11	Q9NPF2	352 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241		Q9UFV3	132 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	SLC22A20	A6NK97	555 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CLDN24	A6NM45	220 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	DVL2	O14641	736 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	TOX	O94900	526 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CLDN1	O95832	211 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	C8B	P07358	591 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	OPRM1	P35372	400 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	COPZ1	P61923	177 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	SELPLG	Q14242	412 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	VMAC	Q2NL98	169 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC80	Q76M96	950 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	TREML1	Q86YW5	311 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	SLC39A3	Q9BRY0	314 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	PINK1	Q9BXM7	581 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	HCFC1	P51610	2035 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PTPA-222	ENST00000445241	MPDZ	O75970	2070 aa		13.16	□□□□□ -0.3

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