RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 CHP2O43745 196 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 GMFGO60234 142 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CSO75390 466 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 REM1O75628 298 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 HMGN1P05114 100 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ZGLP1P0C6A0 271 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 GALNSP34059 522 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP6V1E1P36543 226 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 PPICP45877 212 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 MTNR1AP48039 350 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 BMXP51813 675 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CDH11P55287 796 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 COPZ1P61923 177 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 RELBQ01201 579 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 RHAGQ02094 409 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 PRKCDQ05655 676 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SPHARQ15513 63 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 LPAL2Q16609 132 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 DGUOKQ16854 277 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 KLHL22Q53GT1 634 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 KIRREL2Q6UWL6 708 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 B3GLCTQ6Y288 498 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 QSOX2Q6ZRP7 698 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 LANCL3Q6ZV70 420 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF367Q7RTV3 350 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ADCK1Q86TW2 530 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 KMT5CQ86Y97 462 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CPOQ8IVL8 374 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 C1orf210Q8IVY1 113 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 OR7G1Q8NGA0 311 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 OR52L1Q8NGH7 329 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 OR13C2Q8NGS9 318 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 FANK1Q8TC84 345 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 FGF11Q92914 225 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 RNFT2Q96EX2 444 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC46A1Q96NT5 459 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 OR6C1Q96RD1 312 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ADOQ96SZ5 270 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 BCL7BQ9BQE9 202 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 NUDT9Q9BW91 350 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 VN1R1Q9GZP7 353 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 DCSTAMPQ9H295 470 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CTSFQ9UBX1 484 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC36A6NLP5 189 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 J3QRK9 145 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 CCRL2O00421 344 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 RCBTB2O95199 551 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 RAB36O95755 333 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 DDAH2O95865 285 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 MYL12AP19105 171 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ETV5P41161 510 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SOX3P41225 446 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ETV1P50549 477 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 FXYD6P3P58550 94 aa3.65□□□□□ -1.82
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LRRTM4-201ENST00000409088 MOGQ16653 247 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC25A30Q5SVS4 291 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 AP1ARQ63HQ0 302 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 FCRLBQ6BAA4 426 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 BTLAQ7Z6A9 289 aa3.65□□□□□ -1.82
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LRRTM4-201ENST00000409088 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC38A9Q8NBW4 561 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 PROKR2Q8NFJ6 384 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 BBS1Q8NFJ9 593 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 OR4F15Q8NGB8 312 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 STT3BQ8TCJ2 826 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF721Q8TF20 911 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 SH3GL3Q99963 347 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 IFT27Q9BW83 186 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 MND1Q9BWT6 205 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 RERGLQ9H628 205 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 PLGRKTQ9HBL7 147 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 ENAMQ9NRM1 1142 aa3.65□□□□□ -1.82
LRRTM4-201ENST00000409088 UBQLN4Q9NRR5 601 aa3.65□□□□□ -1.82
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