RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HMGN2P46Q86SG4 172 aa13.79□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARMC8Q8IUR7 673 aa13.79□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MARVELD2Q8N4S9 558 aa13.79□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR5M1Q8NGP8 315 aa13.79□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RASSF5Q8WWW0 418 aa13.79□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WNT2BQ93097 391 aa13.79□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF583Q96ND8 569 aa13.79□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZFP3Q96NJ6 502 aa13.79□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLHDC3Q9BQ90 382 aa13.79□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TUBA1CQ9BQE3 449 aa13.79□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLHL28Q9NXS3 571 aa13.79□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAGLN3Q9UI15 199 aa13.79□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF175Q9Y473 711 aa13.79□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SHANK1Q9Y566 2161 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSPB2A8KAH6 182 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MFN2O95140 757 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C8BP07358 591 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GP1BBP13224 206 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHRNB4P30926 498 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RYKP34925 604 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC1A3P43003 542 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUP107P57740 925 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COPZ1P61923 177 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SRYQ05066 204 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PMPCAQ10713 525 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSPB2Q16082 182 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC80Q76M96 950 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRGPRGQ86SM5 289 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GGNQ86UU5 652 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LILRA2Q8N149 483 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2T12Q8NG77 320 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIB1Q96RU8 372 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TM9SF2Q99805 663 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PINK1Q9BXM7 581 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RLIMQ9NVW2 624 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NDE1Q9NXR1 346 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC13A4Q9UKG4 626 aa13.78□□□□□ -0.2
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLCA1A8K7I4 914 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SHISA8B8ZZ34 492 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYT5O00445 386 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SEC14L5O43304 696 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADAM11O75078 769 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFNA14P01570 189 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL2RAP01589 272 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FCGR2AP12318 317 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AQP1P29972 269 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IDH2P48735 452 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLK1P49759 484 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLDN20P56880 219 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC15A3Q8IY34 581 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBQLNLQ8IYU4 475 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLIP4Q8N3C7 705 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPRMLQ8N4K4 120 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2V1Q8NHB1 315 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BCAS4Q8TDM0 211 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADGRG7Q96K78 797 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLHL15Q96M94 604 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPAS1Q99742 590 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPAG4Q9NPE6 437 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TIGARQ9NQ88 270 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CMTM6Q9NX76 183 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLCF1Q9UBD9 225 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCD2Q9UBJ2 740 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHST2Q9Y4C5 530 aa13.77□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ELOVL7A1L3X0 281 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 M0QX08 132 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC7A2P52569 658 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLDN15P56746 228 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MERTKQ12866 999 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WBP2NLQ6ICG8 309 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2A2Q6IF42 318 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SEM1Q6ZVN7 128 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FITM2Q8N6M3 262 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNIP2Q8NFZ5 429 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMPDL3BQ92485 455 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF524Q96C55 264 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHRNA9Q9UGM1 479 aa13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC22A20A6NK97 555 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AP3D1O14617 1153 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF208O43345 1280 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RCBTB2O95199 551 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLDN14O95500 239 aa13.75□□□□□ -0.21
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL18BPO95998 194 aa13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms