RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 SDCCAG3Q96C92 435 aa26.88■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGDIGQ99819 225 aa26.88■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 GLSO94925 669 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 HOXC5Q00444 222 aa26.87■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 TAF11Q15544 211 aa26.87■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 NRF1Q16656 503 aa26.87■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 COLEC12Q5KU26 742 aa26.87■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF550Q7Z398 422 aa26.87■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 LACC1Q8IV20 430 aa26.87■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF440Q8IYI8 595 aa26.87■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 GALNT4Q8N4A0 578 aa26.87■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa26.87■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 EPYCQ99645 322 aa26.87■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 PTGES2Q9H7Z7 377 aa26.87■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 REEP1Q9H902 201 aa26.87■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 FAM166BA8MTA8 275 aa26.87■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 E2F6O75461 281 aa26.87■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
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ECHS1-201ENST00000368547 KLRB1Q12918 225 aa26.87■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 CARM1Q86X55 608 aa26.87■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 OR4D11Q8NGI4 311 aa26.87■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 SLC35B4Q969S0 331 aa26.87■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 TAAR6Q96RI8 345 aa26.87■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 B4GALT7Q9UBV7 327 aa26.87■■□□□ 1.89
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ECHS1-201ENST00000368547 PDLIM1O00151 329 aa26.86■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 AP3D1O14617 1153 aa26.86■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 FPR1P21462 350 aa26.86■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF136P52737 540 aa26.86■■□□□ 1.89
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ECHS1-201ENST00000368547 INAQ16352 499 aa26.86■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 HYAL4Q2M3T9 481 aa26.86■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 RNFT1Q5M7Z0 435 aa26.86■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF605Q86T29 641 aa26.86■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 OR6T1Q8NGN1 323 aa26.86■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 PIP5K1AQ99755 562 aa26.86■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 UBQLN3Q9H347 655 aa26.86■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP26.85■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 HPRP00739 348 aa26.85■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 LINGO3P0C6S8 592 aa26.85■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 GDF1P27539 372 aa26.85■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 SLC6A8P48029 635 aa26.85■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 EPS8Q12929 822 aa26.85■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 TOMM20Q15388 145 aa26.85■■□□□ 1.89
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC22A16Q86VW1 577 aa26.85■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM251Q8N6I4 163 aa26.85■■□□□ 1.89
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ECHS1-201ENST00000368547 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa26.85■■□□□ 1.89
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ECHS1-201ENST00000368547 VNN3Q9NY84 501 aa26.85■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 RAB26Q9ULW5 256 aa26.85■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 ACOT7O00154 380 aa26.84■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 EI24O14681 340 aa26.84■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 DIRAS1O95057 198 aa26.84■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 CYP4Z1Q86W10 505 aa26.84■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 USE1Q9NZ43 259 aa26.84■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
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ECHS1-201ENST00000368547 PGCP20142 388 aa26.83■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 DPP4P27487 766 aa26.83■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 MAGEA5P43359 124 aa26.83■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 ALDH3A2P51648 485 aa26.83■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 IST1P53990 364 aa26.83■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 DAG1Q14118 895 aa26.83■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 NPTX1Q15818 432 aa26.83■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 STK32CQ86UX6 486 aa26.83■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF524Q96C55 264 aa26.83■■□□□ 1.89
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ECHS1-201ENST00000368547 DKKL1Q9UK85 242 aa26.83■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 ACAD8Q9UKU7 415 aa26.83■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 VDAC3Q9Y277 283 aa26.83■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 LRCH1Q9Y2L9 728 aa26.83■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 ATRXP46100 2492 aa26.83■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 FREM3P0C091 2139 aa26.83■■□□□ 1.89
ECHS1-201ENST00000368547 TPST2O60704 377 aa26.83■■□□□ 1.88
ECHS1-201ENST00000368547 UQCRBP14927 111 aa26.83■■□□□ 1.88
ECHS1-201ENST00000368547 RRM2P31350 389 aa26.83■■□□□ 1.88
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.88
ECHS1-201ENST00000368547 HMGA2P52926 109 aa26.83■■□□□ 1.88
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa26.83■■□□□ 1.88
ECHS1-201ENST00000368547 MED17Q9NVC6 651 aa26.83■■□□□ 1.88
ECHS1-201ENST00000368547 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.88
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