RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357714.5

CD46-204, Transcript of CD46 molecule, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CD46, Length 3,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46-204ENST00000357714 HES5Q5TA89 166 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 TMEM64Q6YI46 380 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 OVCH2Q7RTZ1 564 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 ZNF547Q8IVP9 402 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 PDZD9Q8IXQ8 264 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 OR6V1Q8N148 313 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 SCARB1Q8WTV0 552 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 PTP4A1Q93096 173 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 COL26A1Q96A83 441 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 DTD2Q96FN9 168 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 DERL3Q96Q80 235 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 ZNF416Q9BWM5 594 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 DPEP2Q9H4A9 486 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 INPP5EQ9NRR6 644 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 SAGE1Q9NXZ1 904 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 TAS2R10Q9NYW0 307 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 MED11Q9P086 117 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 KLK11Q9UBX7 282 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 GMEB2Q9UKD1 530 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 CCL26Q9Y258 94 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa7.13□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 UBE2QL1A1L167 161 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 MAN2B1O00754 1011 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 EMC8O43402 210 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 KLF4O43474 513 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 FMO6PO60774 539 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 LILRB5O75023 590 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 ITGA10O75578 1167 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 KRT33AO76009 404 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 TYRP14679 529 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 IFNGR1P15260 489 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 CST5P28325 142 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 GDI2P50395 445 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 PDX1P52945 283 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 FOXK2Q01167 660 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 DEFA5Q01523 94 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 DUSP2Q05923 314 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 STX4Q12846 297 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 TFAP2EQ6VUC0 442 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 NHLRC1Q6VVB1 395 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 ZNF793Q6ZN11 406 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 ADIPOR2Q86V24 386 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 FAM71CQ8NEG0 241 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 OR9A2Q8NGT5 310 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 OR51A7Q8NH64 312 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 ELP4Q96EB1 424 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 HS6ST2Q96MM7 605 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 OR14A2Q96R54 314 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 FN3KQ9H479 309 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 NANSQ9NR45 359 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 PIPOXQ9P0Z9 390 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 KLHL9Q9P2J3 617 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 FBXL4Q9UKA2 621 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 ATG4BQ9Y4P1 393 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 KIAA1671Q9BY89 1806 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 A0A0A6YYD5 115 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 NAP1L6A6NFF2 107 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 A8MXK9 166 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 SUSD5O60279 629 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 SIX6O95475 246 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 PTHLHP12272 177 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 PRKAR1BP31321 381 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 MPIP34949 423 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 HCCSP53701 268 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 CLDN12P56749 244 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 REEP5Q00765 189 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 ZNF85Q03923 595 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 RAB33AQ14088 237 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 GPNMBQ14956 572 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 UBE2NLQ5JXB2 153 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 ZNF613Q6PF04 617 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 TCEAL8Q8IYN2 117 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 CDK20Q8IZL9 346 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 BVESQ8NE79 360 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 OR2L2Q8NH16 312 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 OR4C6Q8NH72 309 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 SFXN5Q8TD22 340 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 FCAMRQ8WWV6 532 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 ORAI1Q96D31 301 aa7.12□□□□□ -1.27
CD46-204ENST00000357714 NUS1Q96E22 293 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms