RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 GALPQ9UBC7 116 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-202ENST00000334414 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-202ENST00000334414 B4DXG7 233 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-202ENST00000334414 PTHP01270 115 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-202ENST00000334414 ALPIP09923 528 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-202ENST00000334414 CSF2RAP15509 400 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-202ENST00000334414 SELPP16109 830 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-202ENST00000334414 DCTP40126 519 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-202ENST00000334414 EFNA3P52797 238 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-202ENST00000334414 OVCH1Q7RTY7 1134 aa5.2□□□□□ -1.58
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PTPRB-202ENST00000334414 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
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PTPRB-202ENST00000334414 PLBD1Q6P4A8 553 aa5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-202ENST00000334414 OR5L1Q8NGL2 311 aa5.2□□□□□ -1.58
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PTPRB-202ENST00000334414 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
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PTPRB-202ENST00000334414 OR10A3P58181 314 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRB-202ENST00000334414 OR13C4Q8NGS5 318 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-202ENST00000334414 TSLPQ969D9 159 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-202ENST00000334414 ISL2Q96A47 359 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRB-202ENST00000334414 VAMP8Q9BV40 100 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRB-202ENST00000334414 PEX10O60683 326 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRB-202ENST00000334414 GNB3P16520 340 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRB-202ENST00000334414 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-202ENST00000334414 M0R3H8 397 aa5.19□□□□□ -1.58
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PTPRB-202ENST00000334414 IL33O95760 270 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-202ENST00000334414 ADH5P11766 374 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-202ENST00000334414 ODF4Q2M2E3 257 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-202ENST00000334414 CES4AQ5XG92 561 aa5.19□□□□□ -1.58
PTPRB-202ENST00000334414 FAM185AQ8N0U4 392 aa5.19□□□□□ -1.58
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