RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299295.6

CHODL-201, Transcript of chondrolectin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHODL, Length 2,548 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHODL-201ENST00000299295 BPIFA2Q96DR5 249 aa20.4■□□□□ 0.86
CHODL-201ENST00000299295 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.4■□□□□ 0.86
CHODL-201ENST00000299295 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CHODL-201ENST00000299295 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CHODL-201ENST00000299295 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CHODL-201ENST00000299295 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa20.4■□□□□ 0.86
CHODL-201ENST00000299295 MPC2O95563 127 aa20.39■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 GSG1Q2KHT4 349 aa20.39■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 DEFB134Q4QY38 66 aa20.39■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 SLC44A3Q8N4M1 653 aa20.39■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 PIGKQ92643 395 aa20.39■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 HDAC8Q9BY41 377 aa20.39■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 CMC2Q9NRP2 79 aa20.39■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 DUXAA6NLW8 204 aa20.38■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 GPR171O14626 319 aa20.38■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 SC5DO75845 299 aa20.38■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 NDUFS1P28331 727 aa20.38■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 AGBL4Q5VU57 503 aa20.38■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 DHRS9Q9BPW9 319 aa20.38■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 A0A1W2PP55 124 aa20.38■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 FAM86C2PA6NEL3 165 aa20.38■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 SSNA1O43805 119 aa20.38■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 LYPD3O95274 346 aa20.38■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 TPOP07202 933 aa20.38■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 SHC2P98077 582 aa20.38■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa20.38■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 CEP76Q8TAP6 659 aa20.38■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 SIGLEC7Q9Y286 467 aa20.38■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 I3L521 148 aa20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 EML2O95834 649 aa20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 CFDP00746 253 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 MAGEB1P43366 347 aa20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 CAMK2DQ13557 499 aa20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 CD276Q5ZPR3 534 aa20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 MFSD9Q8NBP5 474 aa20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 FN3KQ9H479 309 aa20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 SLC22A31A6NKX4 558 aa20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 LDB3O75112 727 aa20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 H2AFB2P0C5Z0 115 aa20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 SELENOPP49908 381 aa20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 ZP1P60852 638 aa20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 RGS1Q08116 209 aa20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 RPE65Q16518 533 aa20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 LUZP2Q86TE4 346 aa20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 ASPGQ86U10 573 aa20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 TPRA1Q86W33 373 aa20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 OMA1Q96E52 524 aa20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 SPEF1Q9Y4P9 236 aa20.37■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 GNB5O14775 395 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 PDGFAP04085 211 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 CEACAM5P06731 702 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 CTNNB1P35222 781 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 NUDT1P36639 197 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 ARFIP1P53367 373 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 PLAURQ03405 335 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 DUSP8Q13202 625 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 TMEM255AQ5JRV8 349 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 ZNF527Q8NB42 609 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 HMGB4Q8WW32 186 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 DERL3Q96Q80 235 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 OR2M2Q96R28 347 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 CARNS1A5YM72 827 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 TRABD2BA6NFA1 517 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 EPXP11678 715 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 LAMP2P13473 410 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 RUNX2Q13950 521 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 ZAR1Q86SH2 424 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 GLRX5Q86SX6 157 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 ZNF614Q8N883 585 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 PTCHD1Q96NR3 888 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 SORCS2Q96PQ0 1159 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 OR14A2Q96R54 314 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 DLL4Q9NR61 685 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 ATG2BQ96BY7 2078 aa20.36■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa20.35■□□□□ 0.85
CHODL-201ENST00000299295 LINC00862A6NCI5 91 aa20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms