RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290317.9

SLC13A3-202, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC13A3, Length 3,994 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-202ENST00000290317 TIGD6Q17RP2 521 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF385BQ569K4 471 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 C1orf189Q5VU69 101 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF793Q6ZN11 406 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 RAB11FIP2Q7L804 512 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 OR51Q1Q8NH59 317 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 YIPF6Q96EC8 236 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 MVB12AQ96EY5 273 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 CMKLR1Q99788 373 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ACTRT3Q9BYD9 372 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 GSX2Q9BZM3 304 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ACTR6Q9GZN1 396 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ASB4Q9Y574 426 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ALG5Q9Y673 324 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 R4GN57 208 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 CHD7Q9P2D1 2997 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ASPDHA6ND91 283 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 H0YIG0 161 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ADAMDEC1O15204 470 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ALPPP05187 535 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 JMJD7P0C870 316 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 MC3RP41968 323 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 COTL1Q14019 142 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 BICRALQ6AI39 1079 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 GUSBP11Q6P575 273 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 NR4A3Q92570 626 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 RDH12Q96NR8 316 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 CXorf36Q9H7Y0 433 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 Q9N2J8 555 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 FAM60AQ9NP50 221 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 PTGFRNQ9P2B2 879 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 UNC13CQ8NB66 2214 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 A0A0A6YYJ9 748 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ARGFXA6NJG6 315 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 TO15178 435 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 CTNSO60931 367 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 CHMP24386 653 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 PCGF2P35227 344 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 RPS26P62854 115 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 CCL7P80098 99 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 E2F1Q01094 437 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 FGL1Q08830 312 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 RUNX2Q13950 521 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 BAK1Q16611 211 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 RFX4Q33E94 735 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 SVOPLQ8N434 492 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 DNAJC22Q8N4W6 341 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 BBS10Q8TAM1 723 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 NETO1Q8TDF5 533 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 SAP25Q8TEE9 199 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 FCGR1BQ92637 280 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 NEURL3Q96EH8 262 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 MS4A4EQ96PG1 132 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 PRRX2Q99811 253 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 MAGIXQ9H6Y5 334 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 FSCN3Q9NQT6 498 aa7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 PATE3B3GLJ2 98 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 B4DXG7 233 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 FABP7O15540 132 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 KCNK5O95279 499 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 AK1P00568 194 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 OPN1SWP03999 348 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 IFNA4P05014 189 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 CYP4B1P13584 511 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 TNFSF8P32971 234 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 IFNGR2P38484 337 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 WNT3P56703 355 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 KCNAB1Q14722 419 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 TRAM2Q15035 370 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 NSDHLQ15738 373 aa7.15□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms