RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260810.9

TOPBP1-201, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOPBP1, Length 5,378 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1-201ENST00000260810 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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TOPBP1-201ENST00000260810 BLKP51451 505 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 NUP107P57740 925 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
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TOPBP1-201ENST00000260810 SATL1Q86VE3 508 aa5.05□□□□□ -1.6
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TOPBP1-201ENST00000260810 NR6A1Q15406 480 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 ENTPD8Q5MY95 495 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 GLYATQ6IB77 296 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 DHRS13Q6UX07 377 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 SPARTQ8N0X7 666 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa5.05□□□□□ -1.6
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TOPBP1-201ENST00000260810 TAAR8Q969N4 342 aa5.05□□□□□ -1.6
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TOPBP1-201ENST00000260810 RNF145Q96MT1 663 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 FGF21Q9NSA1 209 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 GIN1Q9NXP7 522 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 FAM215AQ9Y5M1 114 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 SLC28A1O00337 649 aa5.05□□□□□ -1.6
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TOPBP1-201ENST00000260810 SEC14L2O76054 403 aa5.05□□□□□ -1.6
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TOPBP1-201ENST00000260810 COX7A2P14406 83 aa5.05□□□□□ -1.6
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TOPBP1-201ENST00000260810 SLC26A10Q8NG04 563 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 ACOT12Q8WYK0 555 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 THRSPQ92748 146 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 MSANTD3Q96H12 275 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 MIXL1Q9H2W2 232 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 MED20Q9H944 212 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 STMN3Q9NZ72 180 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 AP4S1Q9Y587 144 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 CLEC18AA5D8T8 446 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 RGS14O43566 566 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 ATP6V1C1P21283 382 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 STT3AP46977 705 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 CLDN20P56880 219 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 CDK5R2Q13319 367 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 FGD3Q5JSP0 725 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 SLC25A30Q5SVS4 291 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 ZFP1Q6P2D0 407 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 CLEC18BQ6UXF7 455 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 MICU2Q8IYU8 434 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 CLEC18CQ8NCF0 446 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 IL17RDQ8NFM7 739 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 LYZL4Q96KX0 146 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 POFUT1Q9H488 388 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 PIGUQ9H490 435 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 TLCD2A6NGC4 264 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 SUV39H1O43463 412 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 IGHEP01854 428 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 IGHG1P01857 330 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 ETV1P50549 477 aa5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TOPBP1-201ENST00000260810 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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