RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ACER3Q9NUN7 267 aa20.04■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 COQ3Q9NZJ6 369 aa20.04■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 TMEM247A6NEH6 219 aa20.03■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 COX4I1P13073 169 aa20.03■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 GP1BBP13224 206 aa20.03■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 PGCP20142 388 aa20.03■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 ELK4P28324 431 aa20.03■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 SCARB2Q14108 478 aa20.03■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 MMEL1Q495T6 779 aa20.03■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 LIN52Q52LA3 116 aa20.03■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 RNF220Q5VTB9 566 aa20.03■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 COMTD1Q86VU5 262 aa20.03■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 CALHM3Q86XJ0 350 aa20.03■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 ZZZ3Q8IYH5 903 aa20.03■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 LILRA2Q8N149 483 aa20.03■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 OR10A6Q8NH74 314 aa20.03■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 ASB5Q8WWX0 329 aa20.03■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 ST8SIA1Q92185 356 aa20.03■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 FIG4Q92562 907 aa20.03■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 WNT2BQ93097 391 aa20.03■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 RCN3Q96D15 328 aa20.03■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 SPATA9Q9BWV2 254 aa20.03■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 TMEM185BQ9H7F4 350 aa20.03■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 C19orf84I3L1E1 186 aa20.02■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 RCBTB2O95199 551 aa20.02■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 TFF3Q07654 80 aa20.02■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 EPS8Q12929 822 aa20.02■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa20.02■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 SERPINA11Q86U17 422 aa20.02■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 OR8J3Q8NGG0 315 aa20.02■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa20.02■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 IFT52Q9Y366 437 aa20.02■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 HCFC1P51610 2035 aa20.02■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 HSPB2A8KAH6 182 aa20.02■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 C5orf58C9J3I9 102 aa20.02■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 FAAHO00519 579 aa20.02■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 TPST1O60507 370 aa20.02■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 GKN3PP0CG01 181 aa20.02■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 PRG2P13727 222 aa20.02■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 SLC6A2P23975 617 aa20.02■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 HTR1EP28566 365 aa20.02■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 SLC6A8P48029 635 aa20.02■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 IDH2P48735 452 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 RBBP4Q09028 425 aa20.02■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 FOXF2Q12947 444 aa20.02■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 HSPB2Q16082 182 aa20.02■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 ZNF311Q5JNZ3 666 aa20.02■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa20.02■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 HIPK4Q8NE63 616 aa20.02■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 OR10D3Q8NH80 312 aa20.02■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 PINK1Q9BXM7 581 aa20.02■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 ZNF232Q9UNY5 417 aa20.02■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 NKX2-6A6NCS4 301 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 TNFSF11O14788 317 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 IL2RAP01589 272 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 ADGRG3Q86Y34 549 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 C11orf65Q8NCR3 313 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 TMEM234Q8WY98 164 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 KLHL15Q96M94 604 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 ZNF583Q96ND8 569 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 CCT8L2Q96SF2 557 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 CTPS2Q9NRF8 586 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 USP22Q9UPT9 525 aa20.01■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 CFAP73A6NFT4 308 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 PRSS44E7EML9 344 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 MFN2O95140 757 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 AQP1P29972 269 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 SFTPDP35247 375 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 DMTNQ08495 405 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 MERTKQ12866 999 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 PON3Q15166 354 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 CYP51A1Q16850 503 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 ZSWIM7Q19AV6 140 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 ACBD4Q8NC06 268 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 OR2V1Q8NHB1 315 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 FNDC9Q8TBE3 224 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 OSTF1Q92882 214 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 TM9SF2Q99805 663 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 WFDC6Q9BQY6 131 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 ADAM19Q9H013 955 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 PIF1Q9H611 641 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 COQ10BQ9H8M1 238 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 GID8Q9NWU2 228 aa20■□□□□ 0.79
SYF2-201ENST00000236273 STOML1Q9UBI4 398 aa20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms