RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	ZFP90	Q8TF47	636 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	HSD17B8	Q92506	261 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	C3orf30	Q96M34	536 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	OR5B2	Q96R09	309 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078		A0A1W2PR80	420 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078		H3BNH8	94 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	SSX4	O60224	188 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	GPRIN2	O60269	458 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	TRIM13	O60858	407 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	CD8A	P01732	235 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	SLC7A1	P30825	629 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	HPCAL1	P37235	193 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	ASMT	P46597	345 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	ATP12A	P54707	1039 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	NAA20	P61599	178 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	ITGAD	Q13349	1161 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	QPRT	Q15274	297 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	GPR68	Q15743	365 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	OR7D2	Q96RA2	312 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	OR10A4	Q9H209	315 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	NGB	Q9NPG2	151 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TCF4-262	ENST00000628078	CAD	P27708	2225 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	GJE1	A6NN92	205 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	SPAG7	O75391	227 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	H6PD	O95479	791 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	NEFH	P12036	1026 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	IGHV1-2	P23083	117 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	SOAT1	P35610	550 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	PGS1	Q32NB8	556 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	IL23R	Q5VWK5	629 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF527	Q8NB42	609 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	MTERF3	Q96E29	417 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	STAC	Q99469	402 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	PSD2	Q9BQI7	771 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	TRIM2	Q9C040	744 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	HHATL	Q9HCP6	504 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	MKLN1	Q9UL63	735 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	RNF212B	A8MTL3	300 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	ESPN	B1AK53	854 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM114	B3SHH9	223 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	ABCD4	O14678	606 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF264	O43296	627 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	FCMR	O60667	390 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	CCNA2	P20248	432 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	ELK4	P28324	431 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	LCN1	P31025	176 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	OR3A2	P47893	321 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	CHRNE	Q04844	493 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	MLC1	Q15049	377 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	P2RY6	Q15077	328 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	PPA1	Q15181	289 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	OR52N5	Q8NH56	324 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	OR5W2	Q8NH69	310 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TCF4-262	ENST00000628078	SDF2	Q99470	211 aa		11.94	□□□□□ -0.5

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