RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCST1Q5T197 706 aa29.95■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa29.95■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC80Q76M96 950 aa29.95■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 DOLPP1Q86YN1 238 aa29.95■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 PM20D2Q8IYS1 436 aa29.95■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRDM14Q9GZV8 571 aa29.95■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 SHISA8B8ZZ34 492 aa29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRKCAP17252 672 aa29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 RYKP34925 604 aa29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A3Q00325 362 aa29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 EMC4Q5J8M3 183 aa29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1QL3Q5VWW1 255 aa29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 C16orf89Q6UX73 402 aa29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 MICU2Q8IYU8 434 aa29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5M9Q8NGP3 310 aa29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM234Q8WY98 164 aa29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ST8SIA1Q92185 356 aa29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC35B4Q969S0 331 aa29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPAS1Q99742 590 aa29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF337Q9Y3M9 751 aa29.94■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 FIGNL2A6NMB9 653 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAM11O75078 769 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 DMTNQ08495 405 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXF1Q12946 379 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC25A53Q5H9E4 307 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRGPRX4Q96LA9 322 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF145Q96MT1 663 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 PINK1Q9BXM7 581 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADA2Q9NZK5 511 aa29.93■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 CFAP73A6NFT4 308 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 T-ENOLP0DO92 83 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 UQCRBP14927 111 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPN1P15169 458 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 GSK3BP49841 420 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 LHX2P50458 406 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 EPS8Q12929 822 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF550Q7Z398 422 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF563Q8TA94 476 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 POC1BQ8TC44 478 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF524Q96C55 264 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDYHV1Q96HA8 205 aa29.92■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1B0GUH1 482 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 B2RBV5 119 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 H3BML4 177 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAAHO00519 579 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR1O75083 606 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 PEPDP12955 493 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 STARP49675 285 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 BCL2A1Q16548 175 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 C4orf17Q53FE4 359 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF585AQ6P3V2 769 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 RELTQ969Z4 430 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 STOML1Q9UBI4 398 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRDM4Q9UKN5 801 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 AP4B1Q9Y6B7 739 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 FLNCQ14315 2725 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 TPST1O60507 370 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 NTN1O95631 604 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 OPN1SWP03999 348 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 GKN3PP0CG01 181 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 GABRA1P14867 456 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF708P17019 499 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ELK4P28324 431 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 SESN3P58005 492 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 EID3Q8N140 333 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC26A7Q8TE54 656 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 RASSF5Q8WWW0 418 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACER3Q9NUN7 267 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAMK2AQ9UQM7 478 aa29.91■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 AP3D1O14617 1153 aa29.9■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 IDH2P48735 452 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 DLX5P56178 289 aa29.9■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLDN18P56856 261 aa29.9■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNC4Q03721 635 aa29.9■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa29.9■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB107AQ8IZN7 70 aa29.9■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMYD1Q8NB12 490 aa29.9■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAMM41Q96BW9 452 aa29.9■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLHL28Q9NXS3 571 aa29.9■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC13A4Q9UKG4 626 aa29.9■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 AHRRA9YTQ3 701 aa29.89■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPOXP36551 454 aa29.89■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 CRYBA2P53672 197 aa29.89■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUSP7Q16829 419 aa29.89■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ULK2Q8IYT8 1036 aa29.89■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNIP2Q8NFZ5 429 aa29.89■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 EVA1AQ9H8M9 152 aa29.89■■■□□ 2.38
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALKBH4Q9NXW9 302 aa29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms