RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 CD82P27701 267 aa16.18■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 ALG10BQ5I7T1 473 aa16.18■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 C1orf94Q6P1W5 598 aa16.18■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa16.18■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 DTX1Q86Y01 620 aa16.18■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 PARP8Q8N3A8 854 aa16.18■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 LINC00471Q8N535 108 aa16.18■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 LAT2Q9GZY6 243 aa16.18■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 CDCP1Q9H5V8 836 aa16.18■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 GALNT9Q9HCQ5 603 aa16.18■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 WDR70Q9NW82 654 aa16.18■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 REV1Q9UBZ9 1251 aa16.18■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 C2orf72A6NCS6 295 aa16.17■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 A6NHS1 94 aa16.17■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 E9PQ18 207 aa16.17■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 GNB5O14775 395 aa16.17■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 OR6B1O95007 311 aa16.17■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 LINGO3P0C6S8 592 aa16.17■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 NAGAP17050 411 aa16.17■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 MST1P26927 711 aa16.17■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 OMPP47874 163 aa16.17■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 IDH2P48735 452 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 TMED10P49755 219 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 ZNF691Q5VV52 312 aa16.17■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 PFN4Q8NHR9 129 aa16.17■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 PIGXQ8TBF5 258 aa16.17■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa16.17■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 TMEM239Q8WW34 195 aa16.17■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 TMCO6Q96DC7 493 aa16.17■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 GMPPBQ9Y5P6 360 aa16.17■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 GPR4P46093 362 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 RPP38P78345 283 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 NTRK2Q16620 822 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 RRM2BQ7LG56 351 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 NUP54Q7Z3B4 507 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 RAB43Q86YS6 212 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 C3orf49Q96BT1 292 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 PITX2Q99697 317 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 PNPLA3Q9NST1 481 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 B4DXG7 233 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 TP53P04637 393 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 CHMP24386 653 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 COPZ1P61923 177 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 KEAP1Q14145 624 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 P3H2Q8IVL5 708 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 SIRT6Q8N6T7 355 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 NACC2Q96BF6 587 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 DSN1Q9H410 356 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 C20orf141Q9NUB4 165 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 AASSQ9UDR5 926 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 ICAM5Q9UMF0 924 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 HRH3Q9Y5N1 445 aa16.16■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 DCHS1Q96JQ0 3298 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 OSMP13725 252 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 POU1F1P28069 291 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 OR5M10Q6IEU7 315 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 ULK3Q6PHR2 472 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 SLC15A4Q8N697 577 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 DUSP19Q8WTR2 217 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 RNF138Q8WVD3 245 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 TTC9Q92623 222 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 KLRF1Q9NZS2 232 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 MAGEA13PA6NCF6 341 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 ICAM2P13598 275 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 LIFP15018 202 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 ELK4P28324 431 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 IFNGR2P38484 337 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 PTGDSP41222 190 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 GAS1P54826 345 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 MLF1P58340 268 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 IL5RAQ01344 420 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 CD47Q08722 323 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 CHAF1BQ13112 559 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 TMEM236Q5W0B7 351 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 WBP2NLQ6ICG8 309 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 IGF2-ASQ6U949 168 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 IL20RBQ6UXL0 311 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 THAP5Q7Z6K1 395 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 VASH2Q86V25 355 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 KIF18BQ86Y91 864 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 ZNF786Q8N393 782 aa16.15■□□□□ 0.18
HERC2-208ENST00000566635 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.5 ms