RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550283.1

RAB5B-208, Transcript of RAB5B, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB5B, Length 665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB5B-208	ENST00000550283	NFKBID	Q8NI38	313 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RAB5B-208	ENST00000550283	RND1	Q92730	232 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RAB5B-208	ENST00000550283	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RAB5B-208	ENST00000550283	CGREF1	Q99674	301 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RAB5B-208	ENST00000550283	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RAB5B-208	ENST00000550283	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RAB5B-208	ENST00000550283	LAT2	Q9GZY6	243 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RAB5B-208	ENST00000550283	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RAB5B-208	ENST00000550283	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RAB5B-208	ENST00000550283	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
RAB5B-208	ENST00000550283	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	C7orf72	A4D263	438 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	CD8B2	A6NJW9	211 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	PRSS44	E7EML9	344 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283		H0Y3Z8	333 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	TPST1	O60507	370 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	KRT34	O76011	436 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	AQP8	O94778	261 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	CLDN14	O95500	239 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	GKN3P	P0CG01	181 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	ARAF	P10398	606 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	PRF1	P14222	555 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	NID1	P14543	1247 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	GPX2	P18283	190 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	MSX1	P28360	303 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	HTR1E	P28566	365 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	RYK	P34925	604 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	CRYBA2	P53672	197 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	DLX5	P56178	289 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	KCNJ10	P78508	379 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	HOXC5	Q00444	222 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	REP15	Q6BDI9	236 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	ZNF527	Q8NB42	609 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	OR5W2	Q8NH69	310 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	PRR14	Q9BWN1	585 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	PIF1	Q9H611	641 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	POLE3	Q9NRF9	147 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	LIPT1	Q9Y234	373 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	GMEB1	Q9Y692	573 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	CACNA1C	Q13936	2221 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	ENO4	A6NNW6	628 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283		H0YHG0	523 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	TNFSF11	O14788	317 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	CXCL13	O43927	109 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	SOX30	O94993	753 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	PGM3	O95394	542 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	NUDT14	O95848	222 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	AGR2	O95994	175 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	GABRA1	P14867	456 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	AQP1	P29972	269 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	SFTPD	P35247	375 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	ACAA2	P42765	397 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	SMS	P52788	366 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	SESN3	P58005	492 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	ART3	Q13508	389 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	NFYC	Q13952	458 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	BCL2A1	Q16548	175 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	AAGAB	Q6PD74	315 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	XKRX	Q6PP77	449 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	MISP	Q8IVT2	679 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	ACBD4	Q8NC06	268 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	PINK1	Q9BXM7	581 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RAB5B-208	ENST00000550283	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8

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