RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 PAX7P23759 505 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 DNASE1P24855 282 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 SOX18P35713 384 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 CPOXP36551 454 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 CD79BP40259 229 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 STARP49675 285 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP4BP51164 291 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF136P52737 540 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 NR1H2P55055 460 aa5.05□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 WDR4P57081 412 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 RAC3P60763 192 aa5.05□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 MPP2Q14168 576 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 SQLEQ14534 574 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 MAPRE2Q15555 327 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 PLPPR5Q32ZL2 321 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 PDZK1Q5T2W1 519 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 CCNJQ5T5M9 372 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 METTL21CQ5VZV1 264 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 AP1ARQ63HQ0 302 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 SAXO2Q658L1 398 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa5.05□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 SLC30A8Q8IWU4 369 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 C9orf106Q8NAJ2 232 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 GATSQ8NAP1 163 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 OR10D3Q8NH80 312 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 RFWD2Q8NHY2 731 aa5.05□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZFP90Q8TF47 636 aa5.05□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 ARSGQ96EG1 525 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 MAGEB18Q96M61 343 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 KLHL15Q96M94 604 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF145Q96MT1 663 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 MED18Q9BUE0 208 aa5.05□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 SAP130Q9H0E3 1048 aa5.05□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 MED4Q9NPJ6 270 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 PARPBPQ9NWS1 579 aa5.05□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 MKLN1Q9UL63 735 aa5.05□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 HRH3Q9Y5N1 445 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 GPR45Q9Y5Y3 372 aa5.05□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 COL6A5A8TX70 2615 aa5.04□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa5.04□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 A6NNC1 897 aa5.04□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 GMFGO60234 142 aa5.04□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 H6PDO95479 791 aa5.04□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 NPPAP01160 153 aa5.04□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 IGKV1D-16P01601 117 aa5.04□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 YES1P07947 543 aa5.04□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 TFPIP10646 304 aa5.04□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 NID1P14543 1247 aa5.04□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 IL11P20809 199 aa5.04□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 ENPP1P22413 925 aa5.04□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC6A2P23975 617 aa5.04□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 CXCR1P25024 350 aa5.04□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
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