RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa25.08■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 PXKQ7Z7A4 578 aa25.08■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 OR51A7Q8NH64 312 aa25.08■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 CITED4Q96RK1 184 aa25.08■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 SERINC2Q96SA4 455 aa25.08■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 ADGRL4Q9HBW9 690 aa25.08■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 FBXL4Q9UKA2 621 aa25.08■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 FABP7O15540 132 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 CHP2O43745 196 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 SC5DO75845 299 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 NDUFS1P28331 727 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 CYB561A3Q8NBI2 242 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 TRAV6A0A075B6T7 132 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 TRAV27A0A087WT01 109 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 P2RX6O15547 441 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 SMIM10L1P0DMW3 83 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 FCN2Q15485 313 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 OR4C6Q8NH72 309 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 SMIM10Q96HG1 83 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 PGLYRP3Q96LB9 341 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 OR2A5Q96R48 311 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 NUDT15Q9NV35 164 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 USP34Q70CQ2 3546 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 XIRP2A4UGR9 3374 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 SOX30O94993 753 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 FCARP24071 287 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF85Q03923 595 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 ACSM3Q53FZ2 586 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 PYHIN1Q6K0P9 492 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF767PQ75MW2 155 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 SHISA5Q8N114 240 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 PHF21AQ96BD5 680 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 TM4SF19Q96DZ7 209 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 MED28Q9H204 178 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 SRMSQ9H3Y6 488 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 MED31Q9Y3C7 131 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 TBC1D3EA0A087X179 549 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 RIIAD1A6NNX1 92 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC31A1O15431 190 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 B3GALT2O43825 422 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 CTSVO60911 334 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 DHFRP00374 187 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 TAS2R43P59537 309 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC36A2Q495M3 483 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 FHL5Q5TD97 284 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 COX18Q8N8Q8 333 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 SMPDL3BQ92485 455 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 GHSRQ92847 366 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC22A7Q9Y694 548 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 LDB3O75112 727 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 RFPL3O75679 317 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 GYPBP06028 91 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 AK4P27144 223 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 PYCR1P32322 319 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 ENPP2Q13822 863 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 CRMP1Q14194 572 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 FIGNL1Q6PIW4 674 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEFF1Q8IYR6 380 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 GHDCQ8N2G8 530 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 HSD17B8Q92506 261 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 ATG2BQ96BY7 2078 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 SCN2AQ99250 2005 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 PTP4A3O75365 173 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 C19orf57Q0VDD7 668 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 AMZ1Q400G9 498 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC44A3Q8N4M1 653 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC23A1Q9UHI7 598 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A0C4DFX4 3053 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 PRSS38A1L453 326 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF860A6NHJ4 632 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 LRRC72A6NJI9 287 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC2A5P22732 501 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 C9orf62Q8N4C0 152 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 BMPERQ8N8U9 685 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 OR5J2Q8NH18 312 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 DUSP22Q9NRW4 184 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 CLEC4AQ9UMR7 237 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 SATB2Q9UPW6 733 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM5Q9Y2B1 443 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 FMO6PO60774 539 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 LRRC17Q8N6Y2 441 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 OR13C5Q8NGS8 318 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 SCMH1Q96GD3 660 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 GHITMQ9H3K2 345 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB3BP20337 219 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 ANKRD54Q6NXT1 300 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP2-221ENST00000511747 CDRT4Q8N9R6 151 aa25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 184 ms