RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC43A2	Q8N370	569 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	NUDT8	Q8WV74	236 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	OSTF1	Q92882	214 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	ARSG	Q96EG1	525 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	MARK4	Q96L34	752 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	OR52B2	Q96RD2	323 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF122	Q9H9V4	155 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	NOTCH2	Q04721	2471 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	C17orf51	A8MQB3	221 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246		C9JVG2	144 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	HMGN4	O00479	90 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	NR5A2	O00482	541 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	ADAMDEC1	O15204	470 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	CXCL13	O43927	109 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	FCMR	O60667	390 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	TFPI	P10646	304 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	PRF1	P14222	555 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	PRKCA	P17252	672 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	IDH3A	P50213	366 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	MAP2K6	P52564	334 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	MERTK	Q12866	999 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	FADD	Q13158	208 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	LIN52	Q52LA3	116 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	BEND4	Q6ZU67	534 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR119	Q8TDV5	335 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	ZFP90	Q8TF47	636 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	FIG4	Q92562	907 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	SPDL1	Q96EA4	605 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	TEX37	Q96LM6	180 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	DACH2	Q96NX9	599 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	INPP5K	Q9BT40	448 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	MED18	Q9BUE0	208 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	GALNT8	Q9NY28	637 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	DOCK7	Q96N67	2140 aa		10.19	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A0G2JPF8	293 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	ANGPT2	O15123	496 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	PRKD3	O94806	890 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	OPN1LW	P04000	364 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	CD8B	P10966	210 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	ENPP1	P22413	925 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	IL12A	P29459	219 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	RYK	P34925	604 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	CD79B	P40259	229 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	PCYT1A	P49585	367 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP4B	P51164	291 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	PHC1	P78364	1004 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	CHRNE	Q04844	493 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	FOXF2	Q12947	444 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	AGK	Q53H12	422 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	CBLN3	Q6UW01	205 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF550	Q7Z398	422 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	GRINA	Q7Z429	371 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	CDH24	Q86UP0	819 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	GGN	Q86UU5	652 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT73	Q86Y46	540 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	ACBD4	Q8NC06	268 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	DDIT4L	Q96D03	193 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	GP6	Q9HCN6	339 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	JKAMP	Q9P055	326 aa		10.18	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	EMC3	Q9P0I2	261 aa		10.18	□□□□□ -0.78

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