RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 RNF212BA8MTL3 300 aa3.99□□□□□ -1.77
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CCL20-204ENST00000489160 PDE5AO76074 875 aa3.99□□□□□ -1.77
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CCL20-204ENST00000489160 OPN1LWP04000 364 aa3.99□□□□□ -1.77
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CCL20-204ENST00000489160 PPIAL4FP0DN26 164 aa3.99□□□□□ -1.77
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CCL20-204ENST00000489160 RPS15P62841 145 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
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CCL20-204ENST00000489160 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CCL20-204ENST00000489160 Q9HAA7 133 aa3.99□□□□□ -1.77
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CCL20-204ENST00000489160 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa3.98□□□□□ -1.77
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CCL20-204ENST00000489160 PANX1Q96RD7 426 aa3.98□□□□□ -1.77
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CCL20-204ENST00000489160 ZNF639Q9UID6 485 aa3.98□□□□□ -1.77
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CCL20-204ENST00000489160 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
CCL20-204ENST00000489160 CPQQ9Y646 472 aa3.98□□□□□ -1.77
CCL20-204ENST00000489160 PNPLA6Q8IY17 1366 aa3.98□□□□□ -1.77
CCL20-204ENST00000489160 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
CCL20-204ENST00000489160 CACNA1FO60840 1977 aa3.98□□□□□ -1.77
CCL20-204ENST00000489160 HECW2Q9P2P5 1572 aa3.97□□□□□ -1.77
CCL20-204ENST00000489160 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa3.97□□□□□ -1.77
CCL20-204ENST00000489160 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa3.97□□□□□ -1.77
CCL20-204ENST00000489160 LRP5LA4QPB2 252 aa3.97□□□□□ -1.77
CCL20-204ENST00000489160 ACOD1A6NK06 481 aa3.97□□□□□ -1.77
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