RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464263.1

RAB11FIP3-208, Transcript of RAB11 family interacting protein 3, human

TSL 3

Gene RAB11FIP3, Length 329 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CD8B2	A6NJW9	211 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263		H0YC42	278 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263		H3BML4	177 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ADAM11	O75078	769 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TOX	O94900	526 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CLDN1	O95832	211 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	THBS1	P07996	1170 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ETS2	P15036	469 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	IL11	P20809	199 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GZMM	P51124	257 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CLDN20	P56880	219 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	QPRT	Q15274	297 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CDSN	Q15517	529 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	REEP3	Q6NUK4	255 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FBXO27	Q8NI29	283 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	BBS10	Q8TAM1	723 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RLIM	Q9NVW2	624 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RNF6	Q9Y252	685 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	IFT52	Q9Y366	437 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263		A0A0G2JNJ9	132 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CDHR4	A6H8M9	788 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	C5orf58	C9J3I9	102 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263		H0Y3Z8	333 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PGC	P20142	388 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SLC6A2	P23975	617 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TIMP3	P35625	211 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CCR4	P51679	360 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	DLX5	P56178	289 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SESN3	P58005	492 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RAC1	P63000	192 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RBBP4	Q09028	425 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	FOXF1	Q12946	379 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SCARB2	Q14108	478 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RABL3	Q5HYI8	236 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SERPINA11	Q86U17	422 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GGN	Q86UU5	652 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LACC1	Q8IV20	430 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OR8J3	Q8NGG0	315 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OR10A6	Q8NH74	314 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RCN3	Q96D15	328 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TRIB1	Q96RU8	372 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SH3GL1	Q99961	368 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GID8	Q9NWU2	228 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	STOML1	Q9UBI4	398 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263		Q9UFV3	132 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LRRK2	Q5S007	2527 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CLCA1	A8K7I4	914 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RYK	P34925	604 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SLC6A8	P48029	635 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ART3	Q13508	389 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LIN52	Q52LA3	116 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	RNF220	Q5VTB9	566 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LILRA2	Q8N149	483 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MEIOB	Q8N635	442 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	HIPK4	Q8NE63	616 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ST8SIA1	Q92185	356 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ADGRG7	Q96K78	797 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RAB11FIP3-208	ENST00000464263	ACER3	Q9NUN7	267 aa		13.87	□□□□□ -0.19

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