RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 LRRC74AQ0VAA2 488 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 BST1Q10588 318 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CBFBQ13951 182 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 POU4F3Q15319 338 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 GPR68Q15743 365 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ATG16L1Q676U5 607 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 C16orf62Q7Z3J2 963 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF614Q8N883 585 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 OR5D16Q8NGK9 328 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM234Q8WY98 164 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ST8SIA1Q92185 356 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 PMM1Q92871 262 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 PIGTQ969N2 578 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 NEURL3Q96EH8 262 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 PIP5K1AQ99755 562 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 KLHDC3Q9BQ90 382 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 NUF2Q9BZD4 464 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 KLHL4Q9C0H6 718 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 OR51I1Q9H343 314 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SERINC1Q9NRX5 453 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 BTNL2Q9UIR0 455 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 PRDM4Q9UKN5 801 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CLEC4AQ9UMR7 237 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1W2PPR1 153 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CCDC154A6NI56 674 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 TRPC5OSA6NMA1 111 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 E9PBE3 544 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 HDAC3O15379 428 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ARHGEF9O43307 516 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ERLIN1O75477 346 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 UGT2B17O75795 530 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CSTAP01040 98 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 YES1P07947 543 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 OR12D1P0DN82 309 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 PGCP20142 388 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 FPR1P21462 350 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SHC1P29353 583 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SLC7A1P30825 629 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 HOXC12P31275 282 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 MAGEA8P43361 318 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SESN3P58005 492 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 UFM1P61960 85 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ADAM8P78325 824 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 FOXF1Q12946 379 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SELENBP1Q13228 472 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 QPRTQ15274 297 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ACKR1Q16570 336 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 PDZK1Q5T2W1 519 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SHEQ5VZ18 495 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SAXO2Q658L1 398 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 STAC2Q6ZMT1 411 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 FCRLAQ7L513 359 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ANKRD46Q86W74 232 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CLEC4FQ8N1N0 589 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 TRIML2Q8N7C3 387 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ANKRD42Q8N9B4 389 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 STEAP2Q8NFT2 490 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 RFWD2Q8NHY2 731 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 RNF128Q8TEB7 428 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ZFP90Q8TF47 636 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ROBO4Q8WZ75 1007 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ROPN1LQ96C74 230 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 PIK3IP1Q96FE7 263 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 MARK4Q96L34 752 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 CCDC115Q96NT0 180 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF350Q9GZX5 532 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM185BQ9H7F4 350 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 ACER3Q9NUN7 267 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 KCNE5Q9UJ90 142 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 MKLN1Q9UL63 735 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRF-210ENST00000463041 LIPT1Q9Y234 373 aa6.5□□□□□ -1.37
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