RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460278.5

ANKRD28-205, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-205ENST00000460278 OMPP47874 163 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ALDH3B2P48448 385 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC11A1P49279 550 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PRELPP51888 382 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PLK1P53350 603 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 VSNL1P62760 191 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PPIAP62937 165 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF45Q02386 682 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 FGL1Q08830 312 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CDH17Q12864 832 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MERTKQ12866 999 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 FOXI1Q12951 378 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CEACAM7Q14002 265 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 GPR18Q14330 331 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 GPR176Q14439 515 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MEF2DQ14814 521 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PPP1R3AQ16821 1122 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ZSWIM7Q19AV6 140 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 DUOXA1Q1HG43 343 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 HKDC1Q2TB90 917 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM119Q4V9L6 283 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 BCL7AQ4VC05 210 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 XKR4Q5GH76 650 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC35D3Q5M8T2 416 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PDSS1Q5T2R2 415 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PDZK1Q5T2W1 519 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 DDI2Q5TDH0 399 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 HECTD2Q5U5R9 776 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ATF7IP2Q5U623 682 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ELP2Q6IA86 826 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC27A4Q6P1M0 643 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ZFP1Q6P2D0 407 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 VITQ6UXI7 678 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 COX8CQ7Z4L0 72 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 AMIGO2Q86SJ2 522 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SLC22A16Q86VW1 577 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 GPBP1Q86WP2 473 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 C17orf64Q86WR6 236 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CDK20Q8IZL9 346 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 COMMD1Q8N668 190 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF248Q8NDW4 579 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 OR5T2Q8NGG2 359 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 UBA3Q8TBC4 463 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 NANPQ8TBE9 248 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SAP25Q8TEE9 199 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PAQR8Q8TEZ7 354 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM37Q8WXS4 190 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MAFIPQ8WZ33 124 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PIK3R3Q92569 461 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ESR2Q92731 530 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 OSTF1Q92882 214 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 UFD1Q92890 307 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MCHR2Q969V1 340 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 TMEM143Q96AN5 459 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 VOPP1Q96AW1 172 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 TESCQ96BS2 214 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 TCEAL4Q96EI5 215 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PDXPQ96GD0 296 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 COQ2Q96H96 371 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 HPDLQ96IR7 371 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 APOLD1Q96LR9 279 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF597Q96LX8 424 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SERPINB11Q96P15 392 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 SIGLEC11Q96RL6 698 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 KRT12Q99456 494 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 NPY6RQ99463 290 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CHP1Q99653 195 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 APOL2Q9BQE5 337 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MND1Q9BWT6 205 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 DERL2Q9GZP9 239 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CCDC90BQ9GZT6 254 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 METTL9Q9H1A3 318 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 Q9H521 79 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 C5orf66Q9H5L9 145 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 LPAR2Q9HBW0 351 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 ASCL3Q9NQ33 180 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PDGFCQ9NRA1 345 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 FGF21Q9NSA1 209 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 RNF186Q9NXI6 227 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 KLHL28Q9NXS3 571 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 PLEK2Q9NYT0 353 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 MSRB1Q9NZV6 116 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD28-205ENST00000460278 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms