RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 AZIN1O14977 448 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ANGPTL7O43827 346 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CELF2O95319 508 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 IMPA1P29218 277 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 KHKP50053 298 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TAS2R38P59533 333 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ERVFC1-1P60608 527 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 DECR1Q16698 335 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MPPE1Q53F39 396 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OAFQ86UD1 273 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 KCNMB4Q86W47 210 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 GPSM1Q86YR5 675 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 BEND2Q8NDZ0 799 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 HDAC8Q9BY41 377 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR2J1Q9GZK6 312 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 C2orf42Q9NWW7 574 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SIX4Q9UIU6 781 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR51B4Q9Y5P0 310 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PRAG1Q86YV5 1406 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 COL15A1P39059 1388 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 E5RJQ4 531 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 M0R1X1 148 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SCN2BO60939 215 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR2F2O95006 317 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 BCAMP50895 628 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 EVX2Q03828 476 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SMAGPQ0VAQ4 97 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 GAGE1Q13065 139 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR2F1Q13607 317 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 KEAP1Q14145 624 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 LTC4SQ16873 150 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MBLAC2Q68D91 279 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 RTL6Q6ICC9 239 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CMC1Q7Z7K0 106 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SLC35G5Q96KT7 338 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 IL4I1Q96RQ9 567 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 IGFLR1Q9H665 355 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ISYNA1Q9NPH2 558 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 YAE1D1Q9NRH1 226 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MROH2BQ7Z745 1585 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 HELTA6NFD8 242 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TRDCB7Z8K6 153 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TP53I11O14683 189 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TNFSF12O43508 249 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 BNIP3LO60238 219 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 GLB1P16278 677 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PRKCHP24723 683 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TEAD1P28347 426 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CTSCP53634 463 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TPPP2P59282 170 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 IL2P60568 153 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SLC36A2Q495M3 483 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 PHYHD1Q5SRE7 291 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR8G2PQ6IF36 304 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 LYPD4Q6UWN0 246 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 LDLRAD3Q86YD5 345 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CLDN22Q8N7P3 220 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR5D16Q8NGK9 328 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR13C4Q8NGS5 318 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OR13C9Q8NGT0 318 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ISOC2Q96AB3 205 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 OMDQ99983 421 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ADAP2Q9NPF8 381 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ARPC3O15145 178 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ARL6IP5O75915 188 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 MT-ND4P03905 459 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ETFAP13804 333 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 RAP1BP61224 184 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CLDN10P78369 228 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 CHIT1Q13231 466 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 HIST3H3Q16695 136 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 SLC5A12Q1EHB4 618 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TTLL9Q3SXZ7 439 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM201Q5SNT2 666 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.25□□□□□ -1.57
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF691Q5VV52 312 aa5.25□□□□□ -1.57
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