RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RHOXF2Q9BQY4 288 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SEC61A2Q9H9S3 476 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ISPDA4D126 451 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FADS1O60427 444 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 THY1P04216 161 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR12D1P0DN82 309 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PGGT1BP53609 377 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CPTPQ5TA50 214 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C18orf63Q68DL7 685 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VN1R5Q7Z5H4 357 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LILRA2Q8N149 483 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DUSP19Q8WTR2 217 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RNF145Q96MT1 663 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF778Q96MU6 729 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RTN4RQ9BZR6 473 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ACOXLQ9NUZ1 547 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NAT2P11245 290 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAHP16930 419 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IL12BP29460 328 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SFTPDP35247 375 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CUL1Q13616 776 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RAB39AQ14964 217 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF527Q8NB42 609 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR52E4Q8NGH9 312 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 F2RL3Q96RI0 385 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COQ10BQ9H8M1 238 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DYRK1BQ9Y463 629 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 E5RI56 91 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KRT20P35900 424 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DAG1Q14118 895 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UGT3A1Q6NUS8 523 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 Q8N1X5 172 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FBXO27Q8NI29 283 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PEX13Q92968 403 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RBBP8Q99708 897 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ISCUQ9H1K1 167 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VPS11Q9H270 941 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PARVBQ9HBI1 364 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TANC2Q9HCD6 1990 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BTBD17A6NE02 478 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WASHC1A8K0Z3 465 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PROSCO94903 275 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UQCRC2P22695 453 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RBL1P28749 1068 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PLPPR5Q32ZL2 321 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCGF3Q3KNV8 242 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OR4C13Q8NGP0 309 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR20Q8TBZ3 569 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NT5DC2Q9H857 520 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRRC40Q9H9A6 602 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SAYSD1Q9NPB0 183 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PHF11Q9UIL8 331 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHST2Q9Y4C5 530 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CACNG2Q9Y698 323 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RNF213Q63HN8 5207 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A1W2PS29 197 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANKDD1BA6NHY2 528 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 F5H0A9 414 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RTCAO00442 366 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DEDDO75618 318 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RBMY1CP0DJD4 496 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RAC3P60763 192 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PSPHP78330 225 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCL8P80075 99 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF763Q0D2J5 394 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HIKESHIQ53FT3 197 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TTMPQ5BVD1 217 aa7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.3 ms