RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 BCL2A1Q16548 175 aa13.6□□□□□ -0.23
PTPRU-204ENST00000428026 DEFB110Q30KQ9 67 aa13.6□□□□□ -0.23
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PTPRU-204ENST00000428026 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
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PTPRU-204ENST00000428026 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
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PTPRU-204ENST00000428026 FAM69BQ5VUD6 431 aa13.59□□□□□ -0.23
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PTPRU-204ENST00000428026 BABAM2Q9NXR7 383 aa13.59□□□□□ -0.23
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PTPRU-204ENST00000428026 ENTHD1Q8IYW4 607 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRU-204ENST00000428026 SLC2A11Q9BYW1 496 aa13.58□□□□□ -0.23
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PTPRU-204ENST00000428026 OR52D1Q9H346 318 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRU-204ENST00000428026 C19orf12Q9NSK7 152 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRU-204ENST00000428026 GDE1Q9NZC3 331 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRU-204ENST00000428026 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa13.58□□□□□ -0.23
PTPRU-204ENST00000428026 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 MEGF11A6BM72 1044 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 TPPPO94811 219 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 PPT1P50897 306 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 TAS2R20P59543 309 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
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