RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407997.3

APOBEC3G-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3G, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-201ENST00000407997 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZSWIM7Q19AV6 140 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRTGQ2VWP7 1150 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 BTBD16Q32M84 506 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 PDZK1Q5T2W1 519 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 PHF19Q5T6S3 580 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 SAXO2Q658L1 398 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 PLAG1Q6DJT9 500 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 ADNP2Q6IQ32 1131 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMEM71Q6P5X7 295 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM92BQ6ZTR7 304 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 ANKRD46Q86W74 232 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 GALNT11Q8NCW6 608 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 PATE1Q8WXA2 126 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 AP3S1Q92572 193 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 UBE2FQ969M7 185 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 INPP5KQ9BT40 448 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 RNF167Q9H6Y7 350 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 WDR70Q9NW82 654 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 GPR83Q9NYM4 423 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF226Q9NYT6 803 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 GLTPQ9NZD2 209 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 NTMQ9P121 344 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 P2RX2Q9UBL9 471 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 TEKT2Q9UIF3 430 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 SNX8Q9Y5X2 465 aa9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 A0A0B4J293 547 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 PMS2P1A4D2B8 440 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARRDC5A6NEK1 342 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 TFECO14948 347 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 TSPAN9O75954 239 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 CSF3P09919 207 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 PSKH1P11801 424 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 ST6GAL1P15907 406 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 LIM2P55344 173 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 CLDN20P56880 219 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 RIN1Q13671 783 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 LY6DQ14210 128 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 SSX1Q16384 188 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZBTB37Q5TC79 503 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 DDI2Q5TDH0 399 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM205BPQ63HN1 556 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 REEP3Q6NUK4 255 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM131AQ6UXB0 335 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF793Q6ZN11 406 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLITRK4Q8IW52 837 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 D2HGDHQ8N465 521 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR4M1Q8NGD0 313 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 LHFPL5Q8TAF8 219 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 OIT3Q8WWZ8 545 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 KLHL6Q8WZ60 621 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 RNF31Q96EP0 1072 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 AMDHD1Q96NU7 426 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 OPALINQ96PE5 141 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 FCRL4Q96PJ5 515 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR1F2PQ96R84 312 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 MED18Q9BUE0 208 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 UCK2Q9BZX2 261 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM117AQ9C073 453 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 MMP28Q9H239 520 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 NARFLQ9H6Q4 476 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 A4GALTQ9NPC4 353 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 CLN6Q9NWW5 311 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 FBXW2Q9UKT8 454 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 MMACHCQ9Y4U1 282 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 A0A1W2PR48 441 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 RTCAO00442 366 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 EFSO43281 561 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 SUV39H1O43463 412 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 ORC5O43913 435 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 GPR75O95800 540 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 AIFM1O95831 613 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 GBAP04062 536 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 PDGFAP04085 211 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 GUSBP08236 651 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 CD63P08962 238 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 CERS1P27544 350 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 RPS19P39019 145 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 KIR2DL3P43628 341 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC9A3P48764 834 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 HSD17B7P56937 341 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 RAB8AP61006 207 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 BTG1P62324 171 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 MED22Q15528 200 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 DEFB134Q4QY38 66 aa9.24□□□□□ -0.93
APOBEC3G-201ENST00000407997 CRB2Q5IJ48 1285 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.6 ms