RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 LIPCP11150 499 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 IL32P24001 234 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 PBX2P40425 430 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 MC2RQ01718 297 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TGFBR3Q03167 851 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 FGL2Q14314 439 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 MSMO1Q15800 293 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 LEXMQ3ZCV2 418 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CRTC1Q6UUV9 634 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ALKAL2Q6UX46 152 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RADILQ96JH8 1075 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF681Q96N22 645 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 DPH1Q9BZG8 443 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SLC25A18Q9H1K4 315 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TAS2R16Q9NYV7 291 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 NCDNQ9UBB6 729 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RARRES3Q9UL19 164 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 MAN2B1O00754 1011 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 GSRP00390 522 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SERPINA7P05543 415 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 DCNP07585 359 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 APEX1P27695 318 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 GABRB3P28472 473 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 DYRK1AQ13627 763 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CLLU1OSQ5K130 101 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 DPY19L4Q7Z388 723 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TPRA1Q86W33 373 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF417Q8TAU3 575 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TAAR8Q969N4 342 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SNX18Q96RF0 628 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 DPH7Q9BTV6 452 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ACPTQ9BZG2 426 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CXCL16Q9H2A7 254 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 B3GNT2Q9NY97 397 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PS29 197 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 FAM183AA6NL82 134 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGAP33O14559 1287 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CSF1P09603 554 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ADRA1AP35348 466 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 CD79BP40259 229 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SLC6A8P48029 635 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 HOXC5Q00444 222 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 MEF2DQ14814 521 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SERPINA11Q86U17 422 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 OR5T1Q8NG75 326 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ARRDC2Q8TBH0 407 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SLC2A12Q8TD20 617 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SMIM14Q96QK8 99 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ATOH8Q96SQ7 321 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 COPS3Q9UNS2 423 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 A0A1W2PPV4 95 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 I6L893 689 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 OR2T1O43869 369 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RDH16O75452 317 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 FGF18O76093 207 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RAB3DO95716 219 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 PTHP01270 115 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 MSX1P28360 303 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 PTGER1P34995 402 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 TAS2R38P59533 333 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF91Q05481 1191 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SERTAD2Q14140 314 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGAP19Q14CB8 494 aa8.34□□□□□ -1.07
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PTPRM-202ENST00000400053 ACSM3Q53FZ2 586 aa8.34□□□□□ -1.07
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PTPRM-202ENST00000400053 BEX5Q5H9J7 111 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 PLXDC1Q8IUK5 500 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 OR5W2Q8NH69 310 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 MYLIPQ8WY64 445 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SLC35B4Q969S0 331 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 NICN1Q9BSH3 213 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 ACTRT3Q9BYD9 372 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-202ENST00000400053 RAB19A4D1S5 217 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SGCEO43556 437 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGEF15O94989 841 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PCGF2P35227 344 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 PRPS1P60891 318 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 SEMA3BQ13214 749 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ADPRMQ3LIE5 342 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF805Q5CZA5 627 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 KIAA1211LQ6NV74 962 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 UEVLDQ8IX04 471 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-202ENST00000400053 FNDC9Q8TBE3 224 aa8.33□□□□□ -1.08
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