RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 PKNOX2Q96KN3 472 aa2.58□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 C4orf36Q96KX1 117 aa2.58□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00167Q96N53 147 aa2.58□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 HES7Q9BYE0 225 aa2.58□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 DCDC2Q9UHG0 476 aa2.58□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 LCMT1Q9UIC8 334 aa2.58□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 SCML2Q9UQR0 700 aa2.58□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 PLLPQ9Y342 182 aa2.58□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 GSAPA4D1B5 854 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 OR1F1O43749 312 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 B3GALNT1O75752 331 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 BBOX1O75936 387 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 PTMAP06454 111 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 PGCP20142 388 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 TBXA2RP21731 343 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 CALB2P22676 271 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 HOXD10P28358 340 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 HPDP32754 393 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 CD80P33681 288 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 MDH1P40925 334 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 ACADVLP49748 655 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC10A7Q0GE19 358 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 CUL1Q13616 776 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 RABGAP1LQ5R372 815 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 AFTPHQ6ULP2 937 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 IGFL2Q6UWQ7 119 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 C16orf62Q7Z3J2 963 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM220AQ7Z4H9 259 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM252Q8N6L7 170 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 FADS6Q8N9I5 356 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 OR2AP1Q8NGE2 309 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF416Q9BWM5 594 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 COQ10BQ9H8M1 238 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 NANSQ9NR45 359 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 AURKCQ9UQB9 309 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 FRMPD4Q14CM0 1322 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 THSD7BQ9C0I4 1608 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A0J9YXY3 114 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 PINLYPA6NC86 204 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 MAPK13O15264 365 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 MSH4O15457 936 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 ECI2O75521 394 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 UGT2B17O75795 530 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 NEBLO76041 1014 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 UFL1O94874 794 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 CA1P00915 261 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 RNH1P13489 461 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP2B6P20813 491 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 NT5EP21589 574 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 PLA2G16P53816 162 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 TLE4Q04727 773 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 NCR3LG1Q68D85 454 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 KIAA1328Q86T90 577 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 DENND6BQ8NEG7 585 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 OR51G2Q8NGK0 314 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 PAQR8Q8TEZ7 354 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 C12orf66Q96MD2 445 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGDIGQ99819 225 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 DPH5Q9H2P9 285 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 MEAF6Q9HAF1 191 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 IFT52Q9Y366 437 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 USP27XA6NNY8 438 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 K7EPI3 171 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 ABCD4O14678 606 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 HCN1O60741 890 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP2.55□□□□□ -22e-6■■■□□ 18.1
RABGGTB-202ENST00000370826 SUPT7LO94864 414 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 SLITRK3O94933 977 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 MFN2O95140 757 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 GNA14O95837 355 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 LALBAP00709 142 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 IFNB1P01574 187 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 ASNSP08243 561 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 NR2C1P13056 603 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 MDKP21741 143 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 TIMM10P62072 90 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 CNTN2Q02246 1040 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 PJVKQ0ZLH3 352 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC57Q2TAC2 916 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 ARMCX2Q7L311 632 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 NRMQ8IXM6 262 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC43Q8N309 656 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 MTURNQ8N3F0 131 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 SVOPLQ8N434 492 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 KIR3DL3Q8N743 410 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 DCAF4L2Q8NA75 395 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 LINC01555Q8NAE3 123 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 OR52I1Q8NGK6 324 aa2.55□□□□□ -2
RABGGTB-202ENST00000370826 OR10T2Q8NGX3 314 aa2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms