RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368378.7

THBS3-201, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,145 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-201ENST00000368378 ST3GAL3Q11203 375 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 SQSTM1Q13501 440 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 TRAM2Q15035 370 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 MEDAGQ5VYS4 303 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 NRSN1Q8IZ57 195 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 LRRC17Q8N6Y2 441 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 OR2T33Q8NG76 320 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 ABHD1Q96SE0 405 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 KXD1Q9BQD3 176 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 TEX12Q9BXU0 123 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 OR10A4Q9H209 315 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 SLC38A1Q9H2H9 487 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 A4GALTQ9NPC4 353 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 GNG8Q9UK08 70 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 TSPAN11A1L157 253 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 A8MVJ9 347 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 H7C1C5 153 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 PAPLNO95428 1278 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 TFPIP10646 304 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 NAGAP17050 411 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 CTRB1P17538 263 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 ACTR1BP42025 376 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 ACTR1AP61163 376 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 LCN6P62502 163 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 TEKQ02763 1124 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 CRMP1Q14194 572 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 DUSP5Q16690 384 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 BHLHB9Q6PI77 547 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 C19orf48Q6RUI8 117 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 LCTLQ6UWM7 567 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 ENPP7Q6UWV6 458 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 SSX6Q7RTT6 188 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 CDH24Q86UP0 819 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 SLC51BQ86UW2 128 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 PRSS58Q8IYP2 241 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 OR52L1Q8NGH7 329 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 OR2A1Q8NGT9 310 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 OR5J2Q8NH18 312 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 SUN3Q8TAQ9 357 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 CAMK1GQ96NX5 476 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 TSSK2Q96PF2 358 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 DERL3Q96Q80 235 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 SNX18Q96RF0 628 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 ICKQ9UPZ9 632 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 LOC100509620A0A075B734 347 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 A6NJY4 79 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 THY1P04216 161 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 ADRB1P08588 477 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 PIPP12273 146 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 MAKP20794 623 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 MAB21L1Q13394 359 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 ADAM15Q13444 863 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 IRF4Q15306 451 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 WDR88Q6ZMY6 472 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 ZAR1Q86SH2 424 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 TOMM5Q8N4H5 51 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 FAM26EQ8N5C1 309 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 DNAAF1Q8NEP3 725 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 OR4N2Q8NGD1 307 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 OR52E2Q8NGJ4 325 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 RFT1Q96AA3 541 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 OR14A2Q96R54 314 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 UBQLN3Q9H347 655 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 DPEP2Q9H4A9 486 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 ZSCAN32Q9NX65 697 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 MPDZO75970 2070 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 A0A1B0GTH9 108 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 A0A1W2PPV9 198 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 POM121BA6NF01 834 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 MAN2B1O00754 1011 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 HCN1O60741 890 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 ZNF250P15622 560 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 NDUFV2P19404 249 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 GABRA5P31644 462 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 ARHGDIBP52566 201 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 NUBP1P53384 320 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 PGGHGQ32M88 737 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 TMEM91Q6ZNR0 172 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-201ENST00000368378 QSOX2Q6ZRP7 698 aa8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms