RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 PHB2Q99623 299 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 EPHX3Q9H6B9 360 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CUTCQ9NTM9 273 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 NUP98P52948 1817 aa18.98■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA1211LQ6NV74 962 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SBSNQ6UWP8 590 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP18.97■□□□□ 0.636e-8■■■■■ 26.8
CCSAP-203ENST00000366687 CXCL16Q9H2A7 254 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 RGPD2P0DJD1 1756 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 TRAV27A0A087WT01 109 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 FAM183AA6NL82 134 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CSF1P09603 554 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 RAC2P15153 192 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 IDUAP35475 653 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 TGFBR3Q03167 851 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF91Q05481 1191 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 BORAQ6PGQ7 559 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP77Q6ZQR2 320 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF583Q96ND8 569 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 IL37Q9NZH6 218 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 PRAF2O60831 178 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 OR5D14Q8NGL3 314 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 NPRL2Q8WTW4 380 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 MAFIPQ8WZ33 124 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 MSANTD3Q96H12 275 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ZBP1Q9H171 429 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CCL26Q9Y258 94 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ALPLP05186 524 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 NKPD1Q17RQ9 610 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 RGCCQ9H4X1 137 aa18.97■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SMCO3A2RU48 225 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ABLIM3O94929 683 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 GYPBP06028 91 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 PSMB10P40306 273 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF616Q08AN1 781 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 RFLNAQ6ZTI6 216 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ABHD5Q8WTS1 349 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 C4orf36Q96KX1 117 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF285Q96NJ3 590 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 V9GY05 133 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SLC22A5O76082 557 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 RAB38P57729 211 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD54Q6NXT1 300 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SNAPC3Q92966 411 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ACTL6BO94805 426 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 ACP2P11117 423 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 TOMM40LQ969M1 308 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SPIN2AQ99865 258 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CA5BQ9Y2D0 317 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 LAMB4A4D0S4 1761 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 UGT2B7P16662 529 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 TNFRSF17Q02223 184 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CDKN3Q16667 212 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CMTM1Q8IZ96 169 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CLEC1AQ8NC01 280 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 HHIPL1Q96JK4 782 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 HINT2Q9BX68 163 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 OR10A5Q9H207 317 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 OR10A2Q9H208 303 aa18.96■□□□□ 0.63
CCSAP-203ENST00000366687 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D15Q8TC07 691 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 SAGE1Q9NXZ1 904 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 ABRACLQ9P1F3 81 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 BMP4P12644 408 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 APLNRP35414 380 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 PSPHP78330 225 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 FGL2Q14314 439 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 MAP3K3Q99759 626 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 KNG1P01042 644 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 APOC3P02656 99 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 OR8U9P0C7N5 309 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 CD79AP11912 226 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 PTPRRQ15256 657 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM201Q5SNT2 666 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 UBE2UQ5VVX9 321 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 SLC38A5Q8WUX1 472 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 UBR2Q8IWV8 1755 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 RGPD1P0DJD0 1748 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 FAM198BQ6UWH4 519 aa18.95■□□□□ 0.62
CCSAP-203ENST00000366687 GGHQ92820 318 aa18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms