RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 FGFBP3Q8TAT2 258 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 C10orf90Q96M02 699 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FMO2Q99518 471 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM175Q9BSA9 504 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC28BQ9BUN5 200 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ADGRE3Q9BY15 652 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ANGPTL4Q9BY76 406 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RACGAP1Q9H0H5 632 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 DSN1Q9H410 356 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RHOFQ9HBH0 211 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 IL17RBQ9NRM6 502 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TAS2R14Q9NYV8 317 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ABCD2Q9UBJ2 740 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MAN1B1Q9UKM7 699 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZHX2Q9Y6X8 837 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ADAMTS20P59510 1910 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PPW3 197 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MTMR11A4FU01 709 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FAM25AB3EWG3 89 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FAM25CB3EWG5 89 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FAM25GB3EWG6 89 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 K7EPK0 472 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FOXN1O15353 648 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RNMTO43148 476 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SCN2BO60939 215 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 B3GAT3O94766 335 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NOL4O94818 638 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 LYNP07948 512 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CYP11B1P15538 503 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GNLYP22749 145 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CMA1P23946 247 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NMT1P30419 496 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ARRB2P32121 409 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TGFBR2P37173 567 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ARHGDIBP52566 201 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 HMGCS2P54868 508 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 AQP5P55064 265 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 MYL7Q01449 175 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 IL18R1Q13478 541 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ISXQ2M1V0 245 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF699Q32M78 642 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TREML2Q5T2D2 321 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FAM162BQ5T6X4 162 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RGMBQ6NW40 437 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FAM122CQ6P4D5 195 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CORO6Q6QEF8 472 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ENPP7Q6UWV6 458 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 AHSA2Q719I0 299 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GDPD3Q7L5L3 318 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CRYBG2Q8N1P7 616 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SMYD1Q8NB12 490 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM104Q8NE00 496 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OR6S1Q8NH40 331 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 GRPEL2Q8TAA5 225 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RAB1CQ92928 201 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 FAF2Q96CS3 445 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 R3HDM4Q96D70 268 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CPB2Q96IY4 423 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RNF157Q96PX1 679 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CTRCQ99895 268 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 ECSITQ9BQ95 431 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 C17orf62Q9BQA9 187 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CHRDL1Q9BU40 450 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NLNQ9BYT8 704 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 COMMD4Q9H0A8 199 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 KCNK12Q9HB15 430 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 RAB18Q9NP72 206 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SPHK1Q9NYA1 384 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 NLGN3Q9NZ94 848 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 EPHA6Q9UF33 1036 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 CD300AQ9UGN4 299 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 SPTA1P02549 2419 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 A0A075B6Q4 140 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 A0A0G2JN53 185 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OR6C65A6NJZ3 312 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 TSTD3H0UI37 97 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 H0YIZ8 118 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 J3QR06 171 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 M0QZ24 198 aa2.27□□□□□ -2.05
CCSAP-202ENST00000366686 OVOL3O00110 214 aa2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.3 ms