RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360325.11

CLDN7-201, Transcript of claudin 7, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN7, Length 1,542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7-201ENST00000360325 SNTA1Q13424 505 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 NHSL2Q5HYW2 709 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 WBP2NLQ6ICG8 309 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 WDR88Q6ZMY6 472 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 AQP11Q8NBQ7 271 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 ZNF248Q8NDW4 579 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 SGCZQ96LD1 299 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 SDHAF3Q9NRP4 125 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 STMN3Q9NZ72 180 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 RAB26Q9ULW5 256 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 WIF1Q9Y5W5 379 aa15.62■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 CFAP54Q96N23 3096 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 MITFO75030 526 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 GASTP01350 101 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 CCL3P10147 92 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 PGCP20142 388 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 ITPKBP27987 946 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 HLCSP50747 726 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 RAD23AP54725 363 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 CBFBQ13951 182 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 TAF11Q15544 211 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 COL28A1Q2UY09 1125 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 RFX4Q33E94 735 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 ALG10BQ5I7T1 473 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 ABHD17BQ5VST6 288 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 SLC22A10Q63ZE4 541 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 SLC30A6Q6NXT4 461 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 PGBD2Q6P3X8 592 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 ULK3Q6PHR2 472 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 ZNF730Q6ZMV8 503 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 RTL4Q6ZR62 310 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 GALNT16Q8N428 558 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 RNF217Q8TC41 542 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 TMEM255BQ8WV15 326 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 ZNF524Q96C55 264 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 NTNG2Q96CW9 530 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 CPNE5Q9HCH3 593 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 KRT84Q9NSB2 600 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 MGAT4BQ9UQ53 548 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 POLHQ9Y253 713 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 ORC6Q9Y5N6 252 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 AP4B1Q9Y6B7 739 aa15.61■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 B4DXG7 233 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 GMFGO60234 142 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 ACADSP16219 412 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 C6orf52Q5T4I8 152 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 PRAMEF20Q5VT98 475 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 OR5M10Q6IEU7 315 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 GALNT5Q7Z7M9 940 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 ZNF563Q8TA94 476 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 GPR119Q8TDV5 335 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 C3orf49Q96BT1 292 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 MPP4Q96JB8 637 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 FRMD6Q96NE9 622 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 ANGPTL4Q9BY76 406 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 DPH1Q9BZG8 443 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 ING2Q9H160 280 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 TOR3AQ9H497 397 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 HHATLQ9HCP6 504 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 SELENONQ9NZV5 590 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 CNIH4Q9P003 139 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 ABI3Q9P2A4 366 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 HRH3Q9Y5N1 445 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 MED13Q9UHV7 2174 aa15.6■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 ANKUB1A6NFN9 424 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 KLK10O43240 276 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 EFSO43281 561 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 NUDT14O95848 222 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 ADAP00813 363 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 MST1P26927 711 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 MSX1P28360 303 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 CYB561P49447 251 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 IL1RL1Q01638 556 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 MERTKQ12866 999 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 LINC00114Q6XXX2 140 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 RRM2BQ7LG56 351 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 ZER1Q7Z7L7 766 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 DHRSXQ8N5I4 330 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 TMEM239Q8WW34 195 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 TFAP2CQ92754 450 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 HS6ST2Q96MM7 605 aa15.59■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CLDN7-201ENST00000360325 MBOAT4Q96T53 435 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms