RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358966.6

GGPS1-202, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GGPS1, Length 2,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-202ENST00000358966 ADAM11O75078 769 aa11.7□□□□□ -0.54
GGPS1-202ENST00000358966 TNNI3P19429 210 aa11.7□□□□□ -0.54
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GGPS1-202ENST00000358966 EPHA4P54764 986 aa11.7□□□□□ -0.54
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GGPS1-202ENST00000358966 ZNF226Q9NYT6 803 aa11.68□□□□□ -0.54
GGPS1-202ENST00000358966 TAS2R16Q9NYV7 291 aa11.68□□□□□ -0.54
GGPS1-202ENST00000358966 FLRT3Q9NZU0 649 aa11.68□□□□□ -0.54
GGPS1-202ENST00000358966 REV1Q9UBZ9 1251 aa11.68□□□□□ -0.54
GGPS1-202ENST00000358966 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa11.68□□□□□ -0.54
GGPS1-202ENST00000358966 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
GGPS1-202ENST00000358966 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa11.68□□□□□ -0.54
GGPS1-202ENST00000358966 AGAP5A6NIR3 686 aa11.68□□□□□ -0.54
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