RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 A0A087WUJ7 227 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 B4E171 279 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 M0R129 80 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 PRODHO43272 600 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 ZNF264O43296 627 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 REM1O75628 298 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 PPM1BO75688 479 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 STSP08842 583 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 PNMTP11086 282 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 BMP7P18075 431 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 CCNA2P20248 432 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 CCKBRP32239 447 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 GRK5P34947 590 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 TSPAN7P41732 249 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 KLHL22Q53GT1 634 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 SYT14P1Q58G82 188 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 WBP2NLQ6ICG8 309 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 TMEM205Q6UW68 189 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 LANCL3Q6ZV70 420 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 OR52L1Q8NGH7 329 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 RFKQ969G6 155 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 TMEM80Q96HE8 168 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 RXFP3Q9NSD7 469 aa14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 EFCAB9A8MZ26 197 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 ALG1L2C9J202 215 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 M0R3G1 203 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 CDC42EP2O14613 210 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 SURF4O15260 269 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 HCN1O60741 890 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 ADAM11O75078 769 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 PTP4A3O75365 173 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 DBTP11182 482 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 MAKP20794 623 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 NUBP1P53384 320 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 NRG3P56975 720 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 RNF4P78317 190 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 PLCXD2Q0VAA5 305 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 SKP2Q13309 424 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 LPAL2Q16609 132 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 KIRREL2Q6UWL6 708 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 HSDL2Q6YN16 418 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 CCDC81Q6ZN84 652 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 RNF217Q8TC41 542 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 GRHL3Q8TE85 626 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 RHBDD1Q8TEB9 315 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 VMP1Q96GC9 406 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 LRR1Q96L50 414 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 LMF1Q96S06 567 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 ADOQ96SZ5 270 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 SPSB2Q99619 263 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 OR52D1Q9H346 318 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 USP34Q70CQ2 3546 aa14.92□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 OR6C70A6NIJ9 312 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 GABARAPO95166 117 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 NTN1O95631 604 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 NAGAP17050 411 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 PSMB9P28065 219 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 PCSK6P29122 969 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 SLC9A3P48764 834 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 ZNF91Q05481 1191 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 RAB40BQ12829 278 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 EFR3AQ14156 821 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 NUP54Q7Z3B4 507 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 SLCO6A1Q86UG4 719 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 CADM2Q8N3J6 435 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 LNX2Q8N448 690 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 OR5L2Q8NGL0 311 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 OR4Q3Q8NH05 313 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 PFN4Q8NHR9 129 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 FANK1Q8TC84 345 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 OMA1Q96E52 524 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 PLEKHA8Q96JA3 519 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 LPAR4Q99677 370 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 DPH1Q9BZG8 443 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 UBQLN3Q9H347 655 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 FN3KQ9H479 309 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 HHATLQ9HCP6 504 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 APMAPQ9HDC9 416 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 C20orf141Q9NUB4 165 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa14.91□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 ATE1O95260 518 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 CD63P08962 238 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 ABCD3P28288 659 aa14.9□□□□□ -0.02
HPS1-202ENST00000338546 SMARCD3Q6STE5 483 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms