RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.61
UBE2B-201ENST00000265339 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.61
UBE2B-201ENST00000265339 PHC2Q8IXK0 858 aa18.83■□□□□ 0.61
UBE2B-201ENST00000265339 SLC5A8Q8N695 610 aa18.83■□□□□ 0.61
UBE2B-201ENST00000265339 C19orf18Q8NEA5 215 aa18.83■□□□□ 0.61
UBE2B-201ENST00000265339 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.61
UBE2B-201ENST00000265339 NDC1Q9BTX1 674 aa18.83■□□□□ 0.61
UBE2B-201ENST00000265339 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.61
UBE2B-201ENST00000265339 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa18.83■□□□□ 0.61
UBE2B-201ENST00000265339 SPACA6W5XKT8 324 aa18.83■□□□□ 0.61
UBE2B-201ENST00000265339 SEC14L5O43304 696 aa18.83■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 CDRT1O95170 752 aa18.83■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 OPN1SWP03999 348 aa18.83■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 C8orf89P0DMQ9 161 aa18.83■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 GABRB1P18505 474 aa18.83■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 RAB25P57735 213 aa18.83■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 VEZF1Q14119 521 aa18.83■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 STPG1Q5TH74 334 aa18.83■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 CDCA4Q9BXL8 241 aa18.83■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 RBCK1Q9BYM8 510 aa18.83■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 NDOR1Q9UHB4 597 aa18.83■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 TNFRSF11BO00300 401 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 WWP2O00308 870 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ARSBP15848 533 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 AANATQ16613 207 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 SLC37A3Q8NCC5 494 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 UPRTQ96BW1 309 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM229AB2RXF0 380 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 H0YIG0 161 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 FABP7O15540 132 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 MANFP55145 182 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 TEKQ02763 1124 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 HSPB3Q12988 150 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 TRIQKQ629K1 86 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 PIP4P1Q86T03 277 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 PEX11GQ96HA9 241 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF681Q96N22 645 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 AMDHD1Q96NU7 426 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 GLIPR2Q9H4G4 154 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 RARRES3Q9UL19 164 aa18.82■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 SMIM30A4D0T7 59 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 EFCAB7A8K855 629 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 TIAF1O95411 115 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ATXN8OSP0DMR3 200 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 NTSP30990 170 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 FEN1P39748 380 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 OR1D4P47884 311 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 SUN3Q8TAQ9 357 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 OR5P2Q8WZ92 322 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 PHF21AQ96BD5 680 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 MVB12AQ96EY5 273 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 BBS4Q96RK4 519 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 RERGLQ9H628 205 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 APMAPQ9HDC9 416 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 PRDM9Q9NQV7 894 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ENTPD4Q9Y227 616 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 SCG5P05408 212 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 RNH1P13489 461 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 PTGER1P34995 402 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 OR1E2P47887 323 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 CEBPEQ15744 281 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 MZT2BQ6NZ67 158 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 OR4N5Q8IXE1 308 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 SLC34A3Q8N130 599 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 AGBL5Q8NDL9 886 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 OR10G2Q8NGC3 310 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 GPR137Q96N19 417 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 DOHHQ9BU89 302 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 RACGAP1Q9H0H5 632 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 CXorf36Q9H7Y0 433 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 NDUFAF4Q9P032 175 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 FER1L5A0AVI2 2057 aa18.81■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 TOR1AO14656 332 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 LDB3O75112 727 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 CLEC2LP0C7M8 214 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 APEX1P27695 318 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 CRYBB2P43320 205 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP18.8■□□□□ 0.62e-17■■■■□ 20.2
UBE2B-201ENST00000265339 CLDN6P56747 220 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 RHAGQ02094 409 aa18.8■□□□□ 0.6
UBE2B-201ENST00000265339 ILKQ13418 452 aa18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms