RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 LIX1LQ8IVB5 337 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 CMIPQ8IY22 773 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 FBXO27Q8NI29 283 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 SDCCAG3Q96C92 435 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 ADGRG7Q96K78 797 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 TRIB1Q96RU8 372 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 TMEM38AQ9H6F2 299 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 CLCF1Q9UBD9 225 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 CAPN7Q9Y6W3 813 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 MED12LQ86YW9 2145 aa20.08■□□□□ 0.81
SYF2-201ENST00000236273 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 CLCA1A8K7I4 914 aa20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 EVPLLA8MZ36 301 aa20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 H0Y3Z8 333 aa20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 CYP7B1O75881 506 aa20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 ADH6P28332 368 aa20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 RAC1P63000 192 aa20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 CBFBQ13951 182 aa20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 NANOGP8Q6NSW7 305 aa20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 LACC1Q8IV20 430 aa20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 UBQLNLQ8IYU4 475 aa20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 C9orf106Q8NAJ2 232 aa20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 OR52P1PQ8NH57 321 aa20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 NFKBIDQ8NI38 313 aa20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 WDR60Q8WVS4 1066 aa20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 SLC39A3Q9BRY0 314 aa20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 NANOGQ9H9S0 305 aa20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 RLIMQ9NVW2 624 aa20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa20.07■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 CCDC22O60826 627 aa20.06■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 NUDT14O95848 222 aa20.06■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 OPN1LWP04000 364 aa20.06■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 IL7RP16871 459 aa20.06■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 SHC1P29353 583 aa20.06■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 EIF1P41567 113 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 CDK6Q00534 326 aa20.06■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 MAPRE2Q15555 327 aa20.06■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 ZNF836Q6ZNA1 936 aa20.06■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 CPLX4Q7Z7G2 160 aa20.06■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 PEX5LQ8IYB4 626 aa20.06■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 CLIP4Q8N3C7 705 aa20.06■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa20.06■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 METTL25Q8N6Q8 603 aa20.06■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 POU5F2Q8N7G0 328 aa20.06■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 LILRB4Q8NHJ6 448 aa20.06■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 LRRC58Q96CX6 371 aa20.06■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 CORO2BQ9UQ03 480 aa20.06■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 CDHR4A6H8M9 788 aa20.05■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 BBIP1A8MTZ0 92 aa20.05■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 MRASO14807 208 aa20.05■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 CLDN14O95500 239 aa20.05■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 COL8A1P27658 744 aa20.05■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 GRNP28799 593 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 CCR4P51679 360 aa20.05■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 SESN3P58005 492 aa20.05■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 GNA13Q14344 377 aa20.05■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa20.05■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 BBS10Q8TAM1 723 aa20.05■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 MRGPRX4Q96LA9 322 aa20.05■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 A0A0J9YW62 118 aa20.04■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa20.04■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 AP3D1O14617 1153 aa20.04■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 ADAMDEC1O15204 470 aa20.04■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 SEC14L5O43304 696 aa20.04■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 TGM6O95932 706 aa20.04■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 NPPAP01160 153 aa20.04■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 THBS1P07996 1170 aa20.04■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 ETS2P15036 469 aa20.04■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 CHRNB4P30926 498 aa20.04■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 RYKP34925 604 aa20.04■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 ZNF136P52737 540 aa20.04■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 RABL3Q5HYI8 236 aa20.04■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 REEP3Q6NUK4 255 aa20.04■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa20.04■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 MEIOBQ8N635 442 aa20.04■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 SMPDL3BQ92485 455 aa20.04■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 UCK2Q9BZX2 261 aa20.04■□□□□ 0.8
SYF2-201ENST00000236273 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms