RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599560.5

NUP62-216, Transcript of nucleoporin 62, human

TSL 2

Gene NUP62, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP62-216	ENST00000599560	GABRA3	P34903	492 aa		10.53	□□□□□ -0.72
NUP62-216	ENST00000599560	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	10.53	□□□□□ -0.72
NUP62-216	ENST00000599560	PPP1R7	Q15435	360 aa		10.53	□□□□□ -0.72
NUP62-216	ENST00000599560	ADIPOQ	Q15848	244 aa		10.53	□□□□□ -0.72
NUP62-216	ENST00000599560	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		10.53	□□□□□ -0.72
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		10.53	□□□□□ -0.72
NUP62-216	ENST00000599560	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		10.53	□□□□□ -0.72
NUP62-216	ENST00000599560	SLC43A2	Q8N370	569 aa		10.53	□□□□□ -0.72
NUP62-216	ENST00000599560	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		10.53	□□□□□ -0.72
NUP62-216	ENST00000599560	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		10.53	□□□□□ -0.72
NUP62-216	ENST00000599560	ZFP90	Q8TF47	636 aa		10.53	□□□□□ -0.72
NUP62-216	ENST00000599560	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		10.53	□□□□□ -0.72
NUP62-216	ENST00000599560	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	10.53	□□□□□ -0.72
NUP62-216	ENST00000599560	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		10.53	□□□□□ -0.72
NUP62-216	ENST00000599560	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	10.53	□□□□□ -0.72
NUP62-216	ENST00000599560	FKRP	Q9H9S5	495 aa		10.53	□□□□□ -0.72
NUP62-216	ENST00000599560		Q9N2J8	555 aa		10.53	□□□□□ -0.72
NUP62-216	ENST00000599560	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		10.53	□□□□□ -0.72
NUP62-216	ENST00000599560	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		10.53	□□□□□ -0.72
NUP62-216	ENST00000599560	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		10.53	□□□□□ -0.72
NUP62-216	ENST00000599560	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	10.53	□□□□□ -0.72
NUP62-216	ENST00000599560	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	10.53	□□□□□ -0.72
NUP62-216	ENST00000599560	GFAP	P14136	432 aa		10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	ADRA2C	P18825	462 aa		10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	SERPINF1	P36955	418 aa		10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF117	Q03924	483 aa		10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	FOXL1	Q12952	345 aa		10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	CBLN3	Q6UW01	205 aa		10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	SSX8	Q7RTT4	187 aa		10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF786	Q8N393	782 aa		10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	DUX5	Q96PT3	197 aa		10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	PLK3	Q9H4B4	646 aa		10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	SENP1	Q9P0U3	644 aa		10.52	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560		A0A087WV62	115 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF724	A8MTY0	619 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	PDLIM1	O00151	329 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	COQ9	O75208	318 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	H6PD	O95479	791 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	OR4A8	P0C604	315 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	IFNGR1	P15260	489 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	ELK4	P28324	431 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	SSTR1	P30872	391 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	PPOX	P50336	477 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	CCNG1	P51959	295 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	RAC3	P60763	192 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	VHLL	Q6RSH7	139 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	C1QL4	Q86Z23	238 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	OR2L13	Q8N349	312 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF527	Q8NB42	609 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	TRIM58	Q8NG06	486 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	LRRC39	Q96DD0	335 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	CA10	Q9NS85	328 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF225	Q9UK10	706 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		10.51	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	MSMB	P08118	114 aa		10.5	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	PCMT1	P22061	227 aa		10.5	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	MAP3K8	P41279	467 aa		10.5	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	FNTA	P49354	379 aa		10.5	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	10.5	□□□□□ -0.73	8e-7	■□□□□ 8
NUP62-216	ENST00000599560	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	SLC29A2	Q14542	456 aa		10.5	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		10.5	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	RAPH1	Q70E73	1250 aa		10.5	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		10.5	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		10.5	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	FBXO30	Q8TB52	745 aa		10.5	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		10.5	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		10.5	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	DNAJA3	Q96EY1	480 aa		10.5	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	GPR78	Q96P69	363 aa		10.5	□□□□□ -0.73
NUP62-216	ENST00000599560	JMJD8	Q96S16	334 aa		10.5	□□□□□ -0.73

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