RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558961.1

BMP4-204, Transcript of bone morphogenetic protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene BMP4, Length 495 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4-204ENST00000558961 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 SCDO00767 359 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 MRASO14807 208 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 AIM2O14862 343 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 CFLARO15519 480 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 TNFRSF21O75509 655 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 AK1P00568 194 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 IL6P05231 212 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 CRHP06850 196 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 GUSBP08236 651 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 PGM1P36871 562 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 DGKQP52824 942 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 SORDQ00796 357 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 TLE4Q04727 773 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 SRYQ05066 204 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 PGS1Q32NB8 556 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 PLPPR5Q32ZL2 321 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 SPDYE7PQ495Y7 208 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 KLHL26Q53HC5 615 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 PAGE3Q5JUK9 113 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 SPANXN4Q5MJ08 99 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 SAXO2Q658L1 398 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 ARSKQ6UWY0 536 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 C16orf89Q6UX73 402 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 DLEU7Q6UYE1 221 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 GGNQ86UU5 652 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 MEIOBQ8N635 442 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 METTL25Q8N6Q8 603 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 OIT3Q8WWZ8 545 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 ZBTB8AQ96BR9 441 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 OR7D2Q96RA2 312 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 HOXD1Q9GZZ0 328 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 TMEM181Q9P2C4 612 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 ABCD2Q9UBJ2 740 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 CD300AQ9UGN4 299 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 ZNF337Q9Y3M9 751 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 ZNF175Q9Y473 711 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 AP4B1Q9Y6B7 739 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 KCNE3Q9Y6H6 103 aa10.13□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 OTOGQ6ZRI0 2925 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 FAM221AA4D161 298 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 CCDC154A6NI56 674 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 DUXAA6NLW8 204 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 C9JVG2 144 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 NR5A2O00482 541 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 MGRN1O60291 552 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 TNFSF13O75888 250 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 TGM6O95932 706 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 LINGO3P0C6S8 592 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 HPGDP15428 266 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 ATP6V1C1P21283 382 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 UQCRC2P22695 453 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 SOAT1P35610 550 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 PCYT1AP49585 367 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 NUDT2P50583 147 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 CLDN20P56880 219 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 KRTAP10-9P60411 292 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 ZNF117Q03924 483 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 FOXF2Q12947 444 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 RIPK1Q13546 671 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 GUSBP1Q15486 140 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 SPATS1Q496A3 300 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 ANXA8L1Q5VT79 327 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 OR2A2Q6IF42 318 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 C6orf120Q7Z4R8 191 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 LURAP1LQ8IV03 231 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 DEFB107AQ8IZN7 70 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 ARHGAP24Q8N264 748 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 GATSQ8NAP1 163 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 ZNF527Q8NB42 609 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 VPS37AQ8NEZ2 397 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 OR5D16Q8NGK9 328 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 GTF2H4Q92759 462 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 VPS33AQ96AX1 596 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 LRRC46Q96FV0 321 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 ADGRG7Q96K78 797 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 CCDC115Q96NT0 180 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 SDF2Q99470 211 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 KLHDC3Q9BQ90 382 aa10.12□□□□□ -0.79
BMP4-204ENST00000558961 ZNF350Q9GZX5 532 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms