RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	DOCK7	Q96N67	2140 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM23-231	ENST00000557549	FBN2	P35556	2912 aa		11.15	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	AGAP5	A6NIR3	686 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CD8B2	A6NJW9	211 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC22	O60826	627 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	TFPT	P0C1Z6	253 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF708	P17019	499 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	LSP1	P33241	339 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	TIMP3	P35625	211 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	LHX2	P50458	406 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	KCNJ10	P78508	379 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF117	Q03924	483 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CHRNE	Q04844	493 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	TFF3	Q07654	80 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CBFB	Q13951	182 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SYPL1	Q16563	259 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	GTDC1	Q4AE62	458 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	RAET1L	Q5VY80	246 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	LACC1	Q8IV20	430 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF614	Q8N883	585 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	GATS	Q8NAP1	163 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ACBD4	Q8NC06	268 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	OR5W2	Q8NH69	310 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	RUBCNL	Q9H714	662 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	MED17	Q9NVC6	651 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	VAPA	Q9P0L0	249 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CREBBP	Q92793	2442 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549		A0A0G2JPF8	293 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	OR2M5	A3KFT3	312 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	GMNC	A6NCL1	334 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	TNFRSF21	O75509	655 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CSTA	P01040	98 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	THBS1	P07996	1170 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CHRM4	P08173	479 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	LINGO3	P0C6S8	592 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	NPIPA8	P0DM63	369 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ETFA	P13804	333 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	NID1	P14543	1247 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ELK4	P28324	431 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	PGM1	P36871	562 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SLC6A8	P48029	635 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	STAR	P49675	285 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	DLX5	P56178	289 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CLDN18	P56856	261 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	KLF10	Q13118	480 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SKP2	Q13309	424 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ARSK	Q6UWY0	536 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SPATA21	Q7Z572	469 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	MED12L	Q86YW9	2145 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	MEIOB	Q8N635	442 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ANKFN1	Q8N957	763 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM234	Q8WY98	164 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ZFP3	Q96NJ6	502 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SH3GL1	Q99961	368 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RBM23-231	ENST00000557549	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63

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