RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 NGBQ9NPG2 151 aa5.07□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 TCF7L2Q9NQB0 619 aa5.07□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 MED17Q9NVC6 651 aa5.07□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 PNPOQ9NVS9 261 aa5.07□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 AIG1Q9NVV5 245 aa5.07□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 GPATCH2Q9NW75 528 aa5.07□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 EMC3Q9P0I2 261 aa5.07□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 P2RX2Q9UBL9 471 aa5.07□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa5.07□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa5.07□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 PROCRQ9UNN8 238 aa5.07□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 VDAC3Q9Y277 283 aa5.07□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 IFT52Q9Y366 437 aa5.07□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF337Q9Y3M9 751 aa5.07□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR45Q9Y484 360 aa5.07□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 ACANP16112 2415 aa5.07□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 CACNA1CQ13936 2221 aa5.07□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A096LPI6 279 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 GXYLT2A0PJZ3 443 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 OR2M5A3KFT3 312 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 NKX2-6A6NCS4 301 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 SERINC4A6NH21 518 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 ADAMDEC1O15204 470 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 CYP7B1O75881 506 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 WISP2O76076 250 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 DBIP07108 87 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 C8BP07358 591 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 LINGO3P0C6S8 592 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 ZCCHC18P0CG32 403 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 EPXP11678 715 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 CRATP43155 626 aa5.06□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 PPP2R2AP63151 447 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNJ10P78508 379 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 PON3Q15166 354 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF141Q15928 474 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 LIN52Q52LA3 116 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 SPANXN4Q5MJ08 99 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM201Q5SNT2 666 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa5.06□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 RTL6Q6ICC9 239 aa5.06□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT73Q86Y46 540 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 LILRA2Q8N149 483 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF619Q8N2I2 560 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 MARVELD2Q8N4S9 558 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 SIMC1Q8NDZ2 872 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 TNIP2Q8NFZ5 429 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 OR6K3Q8NGY3 331 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 OR4C3Q8NH37 302 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 OR5AK3PQ8NH89 298 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 OR2V1Q8NHB1 315 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 SPATA3Q8NHX4 192 aa5.06□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 SMPDL3BQ92485 455 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 DDIT4LQ96D03 193 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 C16orf58Q96GQ5 468 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF607Q96SK3 696 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 SDF2Q99470 211 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 SH3GL1Q99961 368 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC28BQ9BUN5 200 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 UCK2Q9BZX2 261 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 OR51I1Q9H343 314 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 SELENONQ9NZV5 590 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 KLHL9Q9P2J3 617 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 CLCF1Q9UBD9 225 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC13A4Q9UKG4 626 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 USH1CQ9Y6N9 552 aa5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 STAB1Q9NY15 2570 aa5.06□□□□□ -1.6
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CLSTN3-215ENST00000544584 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 C16orf97H3BN30 126 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 SDHDO14521 159 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 GPR171O14626 319 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF195O14628 629 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 DNPH1O43598 174 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 KIAA0513O60268 411 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 SERPINB7O75635 380 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 PRKD3O94806 890 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 OR12D1P0DN82 309 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 CD8BP10966 210 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 POU2F1P14859 743 aa5.05□□□□□ -1.6
CLSTN3-215ENST00000544584 IGFBP2P18065 325 aa5.05□□□□□ -1.6
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