RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540101.2

C16orf62-211, Transcript of UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

TSL 3

Gene C16orf62, Length 461 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62-211ENST00000540101 ADNPQ9H2P0 1102 aa7.13□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 UBQLN3Q9H347 655 aa7.13□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 IL1RAPQ9NPH3 570 aa7.13□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 SACM1LQ9NTJ5 587 aa7.13□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 ARMC1Q9NVT9 282 aa7.13□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 NDUFAF4Q9P032 175 aa7.13□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 TUBD1Q9UJT1 453 aa7.13□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 ANAPC2Q9UJX6 822 aa7.13□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa7.13□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 SH3GLB1Q9Y371 365 aa7.13□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa7.13□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa7.13□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 V9GYQ6 96 aa7.13□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 C2orf72A6NCS6 295 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 G3V3Y1 287 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 MKRN2OSH3BPM6 223 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 AP3D1O14617 1153 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 FKBP6O75344 327 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 GMNNO75496 209 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 GLSO94925 669 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 NTN1O95631 604 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 THY1P04216 161 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 RAP2AP10114 183 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 HPGDP15428 266 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 SLC7A1P30825 629 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 OR1E2P47887 323 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 DNASE1L1P49184 302 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 RPP38P78345 283 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 ARG2P78540 354 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 HOXC5Q00444 222 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 C17orf67Q0P5P2 114 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 EPS8Q12929 822 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 HYAL4Q2M3T9 481 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 TIGD3Q6B0B8 471 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 SLC25A25Q6KCM7 469 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 CARM1Q86X55 608 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF614Q8N883 585 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 OR2M7Q8NG81 312 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 OR2M3Q8NG83 312 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 OR5W2Q8NH69 310 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 DUSP19Q8WTR2 217 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 LZICQ8WZA0 190 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 PROX1Q92786 737 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 SLC47A1Q96FL8 570 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 TPD52L3Q96J77 140 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 DHRS1Q96LJ7 313 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 LRGUKQ96M69 825 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 FUZQ9BT04 418 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 CHID1Q9BWS9 393 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 LAT2Q9GZY6 243 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 METTL7AQ9H8H3 244 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 EVA1AQ9H8M9 152 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 KLRF1Q9NZS2 232 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 FBXL2Q9UKC9 423 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 CARD8Q9Y2G2 431 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 ENPP4Q9Y6X5 453 aa7.12□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 FLNCQ14315 2725 aa7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 TRAV17A0A0B4J275 112 aa7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 A0A0B4J2E0 115 aa7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 A0A1B0GX12 115 aa7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 C7orf72A4D263 438 aa7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 ANKUB1A6NFN9 424 aa7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 H3BNH8 94 aa7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 hCG_2039718K7EN88 272 aa7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 HCRTR2O43614 444 aa7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 PEX1O43933 1283 aa7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 DPM1O60762 260 aa7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 KRT36O76013 467 aa7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 MT-ND1P03886 318 aa7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 P04436 131 aa7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 LINGO3P0C6S8 592 aa7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 RFPL3SP0C7P2 107 aa7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 GKN3PP0CG01 181 aa7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 CNR1P21554 472 aa7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 LIMS1P48059 325 aa7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 P2RX1P51575 399 aa7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 GPR85P60893 370 aa7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 TMEM44Q2T9K0 475 aa7.11□□□□□ -1.27
C16orf62-211ENST00000540101 ZNF766Q5HY98 468 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.1 ms