RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 ART4Q93070 314 aa2.7□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 VMP1Q96GC9 406 aa2.7□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 SPATA13Q96N96 652 aa2.7□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 KLK12Q9UKR0 248 aa2.7□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 DUSP12Q9UNI6 340 aa2.7□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 L3MBTL1Q9Y468 752 aa2.7□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 TRPM7Q96QT4 1865 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 IMPA2O14732 288 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 PPIHO43447 177 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 SLC35G4P0C7Q5 338 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 VDAC1P21796 283 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 TIMM10P62072 90 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 HERVK_113P63132 956 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 ERVK-8P63133 956 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 TEX44Q53QW1 395 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 IRGCQ6NXR0 463 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 CXCL17Q6UXB2 119 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM110Q86TL2 294 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 DCAF4L2Q8NA75 395 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 LINC01555Q8NAE3 123 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 DCUN1D4Q92564 292 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 EEF2KMTQ96G04 330 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 COQ7Q99807 217 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 ERVK-6Q9BXR3 956 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 OR51J1Q9H342 316 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 GLIPR2Q9H4G4 154 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 NUP98P52948 1817 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC7Q96M83 1385 aa2.69□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 ATP10DQ9P241 1426 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 SLX4Q8IY92 1834 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 SAGE2PA6NJ88 616 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 RSPH10B2B2RC85 870 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 DFNA5O60443 496 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 SCRG1O75711 98 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 SEMG1P04279 462 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 ABHD2P08910 425 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 OR8U8P0C7N1 319 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 RSPH10BP0C881 870 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 PSG2P11465 335 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 CCNA2P20248 432 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 ARF5P84085 180 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 TLE4Q04727 773 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 ZP4Q12836 540 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 RPA4Q13156 261 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 KARSQ15046 597 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 SLC15A2Q16348 729 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 METTL11BQ5VVY1 283 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 BTNL3Q6UXE8 466 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF562Q6V9R5 426 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC36Q8IYA8 594 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 ALLCQ8N6M5 410 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 KRT35Q92764 455 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 MCHR2Q969V1 340 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 FGGYQ96C11 551 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 HAVCR1Q96D42 359 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM80Q96HE8 168 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 SMIM14Q96QK8 99 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 SIRPDQ9H106 197 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 GDAP2Q9NXN4 497 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 BCAP29Q9UHQ4 241 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 SPEF2Q9C093 1822 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 TTC21AQ8NDW8 1320 aa2.68□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 KDM3BQ7LBC6 1761 aa2.67□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 PXDNLA1KZ92 1463 aa2.67□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 KDRP35968 1356 aa2.67□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa2.67□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 TTC26A0AVF1 554 aa2.67□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 CASKO14936 926 aa2.67□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 KINO60870 393 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 TIMP1P01033 207 aa2.67□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 JCHAINP01591 159 aa2.67□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 CD55P08174 381 aa2.67□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 STSP08842 583 aa2.67□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 CCNE1P24864 410 aa2.67□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 COPB2P35606 906 aa2.67□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 RPL4P36578 427 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 SLC6A8P48029 635 aa2.67□□□□□ -1.98
CPEB4-210ENST00000522344 GPC3P51654 580 aa2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms