RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF117	Q03924	483 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	TFF3	Q07654	80 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	SELENBP1	Q13228	472 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	HBM	Q6B0K9	141 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	EPGN	Q6UW88	154 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	LUZP2	Q86TE4	346 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF130	Q86XS8	419 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CMIP	Q8IY22	773 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	NAXE	Q8NCW5	288 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ST8SIA1	Q92185	356 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	KLHL15	Q96M94	604 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	LAT2	Q9GZY6	243 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	PKDREJ	Q9NTG1	2253 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	IGFBP2	P18065	325 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	SFTPD	P35247	375 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	HTR3A	P46098	478 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CRISP3	P54108	245 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	AQP5	P55064	265 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CASP9	P55211	416 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	COPZ1	P61923	177 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CD226	Q15762	336 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF141	Q15928	474 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	TTMP	Q5BVD1	217 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ZZZ3	Q8IYH5	903 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	RELL2	Q8NC24	303 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP6V1C2	Q8NEY4	427 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	OR10D3	Q8NH80	312 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXO27	Q8NI29	283 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	RAB8B	Q92930	207 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	LURAP1	Q96LR2	239 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	SH3GL2	Q99962	352 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-231	ENST00000496246	TNFSF12-TNFSF13	A0A0A6YY99	330 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1W2PNV4	684 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	EVPLL	A8MZ36	301 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF195	O14628	629 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	TNFSF11	O14788	317 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	KIAA0513	O60268	411 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	SCN2B	O60939	215 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	UGT2B17	O75795	530 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	H6PD	O95479	791 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	TGM6	O95932	706 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	GSN	P06396	782 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	LINGO3	P0C6S8	592 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	EPX	P11678	715 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	POU2F1	P14859	743 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	HCFC1	P51610	2035 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	CLDN20	P56880	219 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	DSTN	P60981	165 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	SIRPA	P78324	504 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNJ10	P78508	379 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	FOXF1	Q12946	379 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	SQLE	Q14534	574 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	QPRT	Q15274	297 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-231	ENST00000496246	ZAR1	Q86SH2	424 aa		10.2	□□□□□ -0.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms